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使用peer根据表达量数据推断隐藏因子

在做eQTL分析时需要提供隐藏因子作为分析的部分协变量，分析中隐藏因子的引入主要是用来排除影响表达量数据的一些混淆因素，例如样本的采样环境、样本批次、其他位置因素等，这些因素视作分析中的无关因素(即一些无法测量的，但是会影响基因表达的因素)，需要进行预先处理。

单细胞RNA速率（RNA velocity）分析结果解读

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  • 发布于 2024-06-18 12:20
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8月相约南京--群体遗传进化GWAS分析、T2T基因组、泛基因家族、宏基因组等主题培训！

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ProteoWizard工具的安装与使用

ProteoWizard 是一套用于蛋白质组学数据分析和转换的开源软件工具，它支持多种质谱数据格式转换、可以用于谱图查看、质谱仪器参数查看、还可以用于蛋白序列模拟酶切…… ProteoWizard官网：https...

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  • rzx
  • 发布于 2024-06-14 15:13
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gtfToGenePred报错

使用gtfToGenePred的命令和报错： gtfToGenePred -genePredExt  Drosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf refFlat.tmp.txtDrosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf (GFF not supported by t...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-06-13 11:47
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monocle3分析结果解读

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-06-12 17:08
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细胞通讯cellchat结果介绍

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  • 发布于 2024-06-12 16:21
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BCC 基底细胞癌（GSE123813）

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  • 发布于 2024-06-11 17:24
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GEO单细胞转录组数据挖掘示例代码汇总

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  • 发布于 2024-06-11 17:18
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GenePred格式

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  • 发布于 2024-06-11 15:46
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R markdwon 代码块选项说明：

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  • 发布于 2024-06-08 15:25
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An introduction to PERMANOVA and ANOSIM

PERMANOVA（Permutational Multivariate Analysis of Variance）和 ANOSIM（Analysis of Similarities）都是用于分析和比较群组间多元数据差异的统计方法。它们特别适用于生态和环境科学领域，...

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  • xun
  • 发布于 2024-06-05 14:33
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序列的提取和截取

序列的提取是我们生物学分析的基础操作，在许多分析中都会使用到。在这里给大家提供几个提取序列的命令。

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-06-05 14:27
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如何预测CpG岛

在人类基因组的广袤海洋中，隐藏着许多生物学上重要的结构，其中之一就是CpG岛。这些富含CpG二核苷酸的DNA序列区域在基因表达调控中扮演着关键角色。然而，要想有效地理解这些岛屿的功能，首先...

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  • 发布于 2024-06-04 14:44
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QTL定位方法介绍

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  • 发布于 2024-06-03 09:44
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VScode文档列对齐插件-code alignment

一款VScode中文档列对齐的插件

快速整理shell里面用到的脚本；

shell

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  • 发布于 2024-05-24 10:27
  • 阅读 ( 366 )

sed使用

在Linux系统中，sed（stream editor）命令是一个非常强大的文本处理工具。它主要用于对文本文件进行过滤和转换操作，支持非交互式的文本编辑。今天，我们就来深入了解一下sed命令的详细使用方法...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-05-20 15:38
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基于 gff 文件构建 TxDb 包

TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的，用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb （transcript database）包，有两种构建方式，一...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-15 16:45
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基于 gff 文件构建 TxDb 包

TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的，用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb （transcript database）包，有两种构建方式，一...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-15 16:41
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