全部 - 文章 - 第5页 - 组学大讲堂问答社区

单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)

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omicsgene
发布于 2024-07-25 11:01
阅读 ( 640 )

B/T细胞分类：

B细胞分类：

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omicsgene
发布于 2024-07-25 09:50
阅读 ( 713 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE146771)

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omicsgene
发布于 2024-07-24 16:38
阅读 ( 716 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-非小細胞肺癌（NSCLC）(GSE127465)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-癌（NSCLC）(GSE127465)

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omicsgene
发布于 2024-07-24 11:11
阅读 ( 826 )

biom格式的文件如何转化

biom格式的文件如果想要删除某个物种啥的,转换以后直接修改是不行的先转化成tsv biom convert -i bak/feature_table_tax.biom -o feature_table_tax.tsv --to-tsv --header-key taxonomys l...

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xun
发布于 2024-07-23 15:29
阅读 ( 684 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-肝细胞癌（HCC）(GSE149614)

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omicsgene
发布于 2024-07-23 10:33
阅读 ( 815 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)

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omicsgene
发布于 2024-07-22 18:21
阅读 ( 608 )

R语言跑循环，如何跳过报错信息？

当使用循环跑R函数的时候，如果其中某一次循环执行时报错，那么就会中断循环体，并在屏幕上打印出报错信息

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每天学习一点点
发布于 2024-07-12 17:50
阅读 ( 753 )

甲基化水平如何计算

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安生水
发布于 2024-07-11 09:51
阅读 ( 1178 )

add a Convex Hull with module

有的文章会在模块化的群落里加上Convex Hull ,类似这样,如何实现呢,可以借助ggforce的geom_mark_hul 比如我们的示例代码稍作修改 library(ggforce) 主要是加了最后一行,的geom_mark_hull...

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xun
发布于 2024-07-11 09:20
阅读 ( 657 )

给进化树标定化石时间

进化树（Phylogenetic Tree）是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中，每个分支点（节点）代表一个共同祖先，而每个末端的分支（叶节点）代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间，即在进化树上标注时间点，为进化树提供了一个时间框架，便于超度量树的构建

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Ti Amo
发布于 2024-07-10 17:43
阅读 ( 1472 )

pySCENIC转录因子分析结果解读

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omicsgene
发布于 2024-07-09 12:05
阅读 ( 1457 )

对水稻做GO和KEGG富集分析，如何获取水稻的数据库？

我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候，需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包

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每天学习一点点
发布于 2024-07-05 14:39
阅读 ( 1448 )

Mac | Mac M 芯片应用意外退出问题

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omicsgene
发布于 2024-07-04 09:50
阅读 ( 593 )

无法访问zenodo

多个浏览器均无法访问zenodo网站解决方法： 1. 找到ip：188.185.79.172 查询ip的网址：站长工具 - 站长之家 (chinaz.com) 2. 进入C:\WINDOWS\system32\drivers\etc，修改host权限 3、...

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Ti Amo
发布于 2024-07-02 15:58
阅读 ( 1721 )

空间转录组数据预处理

空间转录组简介空间转录组，顾名思义，是在转录组的基础上加上了空间位置信息。如果不借助空间的技术,我们的转录组一般是粉碎组织到细胞层级或者更低的rna碎片层级,而进行sc RNA或者Bulk...

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xun
发布于 2024-07-02 15:56
阅读 ( 752 )

eQTplot包绘图报错解决：“Caused by error in `db_collect()`”

解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题

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每天学习一点点
发布于 2024-06-30 09:52
阅读 ( 655 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-CRC直肠癌(GSE178341)

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omicsgene
发布于 2024-06-27 14:03
阅读 ( 723 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(GSE161529)

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omicsgene
发布于 2024-06-27 13:48
阅读 ( 879 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107)

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omicsgene
发布于 2024-06-27 13:33
阅读 ( 749 )