通过GATK calling出来的SNP如果使用UnifiedGenotype获得的SNP文件是分sample的,但是如果使用vcftools或者ANGSD则需要Vcf文件是multi-sample的,这里就需要我们将不同samples的文件进行合并,可...
全国人大常委会委员蔡昉建议,“纠正大学发展中一个错误导向,取消对研究生甚至本科生发表论文的规定”。
手工编译,上传服务器文件,执行各种命令,启动和停止服务器,发现一个 BUG,改完再重复之前说的步骤...... 如今看起来啼笑皆非的重复劳动,在没有 DevOps 概念之前,全靠 IT 人员手工完成。...
pheatmap 绘图出现报错信息类似: Error in hclust(d, method = method) : 外接函数调用时不能有NA/NaN/Inf(arg11)
骨肉瘤又称为成骨肉瘤,是一种恶性骨肿瘤,多出现早期转移和高死亡率。更好的研究和探索骨肉瘤早期转移的分子机制将有利于进行癌症的治疗,刚好这里就给大家介绍一篇利用公共数据分析的文献:基于共表达分析鉴定骨肉瘤转移相关基因
R语言涉及的R包非常多,如何跟踪R包的更新进展或者新发布的R包,及时进行本地安装或版本迭代
TCGA数据下载教程:使用官方gdc-client软件下载
没有博士能摆脱秃头的恐惧。
TCGA数据分析机构及编码汇总 Center
TCGA中样品取样组织类型编号对照包 sample type
TCGA样品来源机构汇总 Tissue source site(TSS)
TCGA数据处理流程中各种组织机构介绍
癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)计划简介
TCGA数据库中样品编号详解(Barcode)
你希望自己的宝宝成为一个“完美”的人吗?
随着企业业务对软件系统日益依赖,IT管理与研发模式也随之对“敏捷”模式产生了需求,也就是今天人们时常提起的DevOps。提升效率,是DevOps实践的核心内容之一。就让我们来一起从软件生命周期的业...
各大高校都在清退超时无法毕业的博士生,而施校长却主张“不受毕业年限的限制”。
基因家族(Gene family),是来源于同一个祖先,由一个基因通过基因重复而产生两个或更多的拷贝而构成的一组基因,它们在结构和功能上具有明显的相似性,编码相似的蛋白质产物。 基因家族分析...
SignalP:信号肽预测工具
基因家族分析文章常常止步于3-4分,那么5分及以上的文章该怎么写呢?上一期,给大家分享过一篇New Phytologist(IF=7分)上的硬核文章:一篇7分的文章带你领略不一样的基因家族分析(点此链接观...