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植物转录因子基因家族分类及对应的pfam号

植物转录因子基因家族对照表；

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-10 14:13
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Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 进行转录本的合并

Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 进行转录本的合并

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  • microRNA
  • 发布于 2018-08-10 14:03
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MA plot 绘图计算公式

MA图主要应用在基因组数据可视化方面，实现数据分布情况的展示。早期主要应用于DNA芯片数据，现在常用于高通量测序数据中基因差异表达分析结果的展示。 其计算公式如下： M一般做Y轴...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-10 13:20
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GFF与GTF格式转换

GFF与GTF格式转换

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-10 11:53
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教你在线绘制circos图-简单！

相信大家都听说过circos图，但是亲自画过的人可能就很少，这主要因为软件的安装和使用稍微有一点麻烦。其实，circos图也是可以在线绘制的，这样就简单多了！一起来了解一下吧！

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-09 17:15
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ggplot2分面facet_grid调整坐标

ggplot2分面设置facet_grid实现一页多图 facet_grid(facets, margins = FALSE, scales = "fixed", space = "fixed",  shrink = TRUE, labeller = "label_value", as.table = TRUE,  switch = N...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-09 15:01
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Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 融合基因的分析

Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 融合基因的分析

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  • microRNA
  • 发布于 2018-08-09 14:55
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ggplot2主题theme参数

ggplot2绘图theme参数设置 theme(line, rect, text, title, aspect.ratio, axis.title, axis.title.x,  axis.title.x.top, axis.title.y, axis.title.y.right, axis.text, axis.text.x,  axis....

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-08 17:50
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perl中对数组字符串取交集，并集，差集包

Array::Utils ，perl中对两个数据取交集，并集 差集等等，union，intersect，diff等操作

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-06 17:51
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领取180篇2018年最新基因家族分析类文献（文末领取）

趁着基因家族类文章还好发，赶紧发一篇吧！

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-08-06 10:19
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perl中读取和写出Excel的包，xls，和xlsx

介绍两个perl中的包，分别可以读取Excel的文件，包括2003 的xls文件，和2007的xlsx的文件。Spreadsheet::ParseExcel; Spreadsheet::ParseXLSX;

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-05 16:59
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eclipse当中出现中文乱码解决办法 UTF-8

eclipse当中出现中文乱码解决办法

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-03 15:20
  • 阅读 ( 2913 )

miRNA与靶基因相关性作图

miRNA与靶基因相关性作图

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-03 13:02
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提取miRNA前后500bp序列

在没有位置信息时，提取miRNA前后500bp的序列

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-03 11:44
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pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

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  • microRNA
  • 发布于 2018-08-03 10:54
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在线进化树美化网站-iTQL

除了利用Figtree等对进化树进行美化之外：两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图！也有不少在线工具可以实现这项工作，譬如iTQL:http://itol.embl.de/ 进入网站主页之后，选择Upload进入数据上...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-03 10:50
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Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 分析软件 IsoSeq3 的安装

Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 分析软件 IsoSeq3 的安装

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  • 发布于 2018-08-03 09:20
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perl脚本批量生成反向互补序列

有时候我们需要得到序列的反向互补序列，可以用下面的脚本来批量处理序列。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-02 17:14
  • 阅读 ( 5514 )

Mapman对表达数据进行venn绘制

Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外，还可以利用软件之际对多样品数据中注释到Mapmen通路的数据进行venn图绘制。主要操作过程如下： 从Experiments导入表达数据,具体参考文章：植物...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-02 14:01
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cytoscape插件BinGO安装以及GO富集分析和网络可视化

cytoscape插件BinGO安装以及GO富集分析和网络可视化

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-01 18:50
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