NCBI上传高通量测序数据到SRA数据库 aspera 支持续传

Aspera command line upload 数据,最只要的支持续传,如果数据量比较大的话建议用命令行的方法上传,不然,网页上传一旦断开,又得重新上传;

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-30 20:03
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植物嫁接砧木影响接穗代谢通路,激素等等总结

砧木影响接穗的代谢

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-30 16:08
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Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 可变剪切分析软件lr2rmats

Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 可变剪切分析软件lr2rmats

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  • microRNA
  • 发布于 2018-08-24 17:15
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NCBI上传二代测序数据需要的作者信息

SRA提交数据,作者信息

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-24 17:01
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linux-列合并

linux中cat命令可以按行合并多个文件,而按列合并多个文件也是可以的。用到的命令是paste。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-24 15:41
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CentOS linux的环境变量配置

CentOS linux的环境变量配置

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-24 09:29
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利用sed 命令去掉windows下回车符

在Windows中文件的换行符与linux中是不同的,其在linux中显示为^M,在使用脚本处理时并不希望有这个符号,所以需要去掉此符号,其方法如下: sed  -i 's/^M//g'  test.txt    ^M 是回车换行符...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-23 18:22
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ggplot2图片保存

R语言中可以将图片结果保存成pdf或者png,具体涉及两种方法: pdf()和png() 以ggplot2绘图结果: http://www.omicsclass.com/article/92   的图片保存为例 pdf(file = "p.pdf",width =1...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-23 11:42
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ggplot2隐藏图例

这里简单介绍两个隐藏图例的方法 其一利用引导元素guides实现: 譬如借用www.omicsclass.com/article/92 分组柱状图代码: library('ggplot2')library('reshape2')A = c("A","B","C","D","E"...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-23 11:30
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Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 分析软件Cogent 的安装

Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 分析软件Cogent 的安装

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  • 发布于 2018-08-20 11:12
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ggplot2几个主题类型

演示ggplot2几个默认的主题类型,直接套用对应的函数即可 数据参考 http://www.omicsclass.com/article/92 dat   type  Sample Num1     A sample1  902     B sample1  343     C sample1  ...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-17 16:33
  • 阅读 ( 4319 )

饼图pie-ggplot2

绘制饼图的过程中,利用ggplot2的geom_bar结合coord_polar实现,需要理解的点是饼图的排布是按照aes(fill)的因子顺序确定的。譬如数据如下 > dat  type Num1    A  902    B  343    C  56...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-17 14:28
  • 阅读 ( 8978 )

R语言-相关性矩阵分析

R语言-相关性计算

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-17 13:56
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perl 中 grep 的使用

perl 中 grep 的使用

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-17 12:10
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基因功能注释数据库DAVID 版本的更新情况

基因功能注释数据库DAVID 版本的选

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  • 发布于 2018-08-17 11:36
  • 阅读 ( 4909 )

当潜规则遇见科技服务,都是套路

科技服务遇到潜规则,都是套路!

Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 分析软件PRAPI

Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq 3) 分析软件PRAPI 介绍

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  • 发布于 2018-08-17 10:37
  • 阅读 ( 4485 )

perl 中 $#ARGV 是什么意思

perl 中 $#ARGV 是什么意思

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-17 10:37
  • 阅读 ( 5359 )

Pacbio Sequel 下机数据介绍

Pacbio Sequel 下机数据介绍

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  • 发布于 2018-08-15 11:44
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pennCNV软件linux系统安装

pennCNV主要用于芯片数据分析CNV软件

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-13 13:35
  • 阅读 ( 3454 )