7篇家蚕基因家族分析类文献
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 进行转录本与基因组的比对
在线绘制circos的数据格式说明
筛选VCF中指定位置变异位点
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 进行转录本的合并
MA图主要应用在基因组数据可视化方面,实现数据分布情况的展示。早期主要应用于DNA芯片数据,现在常用于高通量测序数据中基因差异表达分析结果的展示。 其计算公式如下: M一般做Y轴...
GFF与GTF格式转换
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 融合基因的分析
ggplot2绘图theme参数设置 theme(line, rect, text, title, aspect.ratio, axis.title, axis.title.x, axis.title.x.top, axis.title.y, axis.title.y.right, axis.text, axis.text.x, axis....
Array::Utils ,perl中对两个数据取交集,并集 差集等等,union,intersect,diff等操作
介绍两个perl中的包,分别可以读取Excel的文件,包括2003 的xls文件,和2007的xlsx的文件。Spreadsheet::ParseExcel; Spreadsheet::ParseXLSX;
eclipse当中出现中文乱码解决办法
miRNA与靶基因相关性作图
在没有位置信息时,提取miRNA前后500bp的序列
除了利用Figtree等对进化树进行美化之外:两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图!也有不少在线工具可以实现这项工作,譬如iTQL:http://itol.embl.de/ 进入网站主页之后,选择Upload进入数据上...
有时候我们需要得到序列的反向互补序列,可以用下面的脚本来批量处理序列。
Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外,还可以利用软件之际对多样品数据中注释到Mapmen通路的数据进行venn图绘制。主要操作过程如下: 从Experiments导入表达数据,具体参考文章:植物...
TCGAbiolinks 下载临床数据,警惕有多次随访数据
如何从某一个文本文件中随机抽取一部分数据。譬如右下方这样的基因表达量数据的统计文件ref_trans_full_table.xls目标是由此文件中随机抽取一部分数据。 可以利用shuf获取随机数据,譬如随机...
dell服务器R430硬盘点击阵列卡