Perl读取文件中的科学计数法数字是是以字符串读取的,需要将其转化为小数,方法如下 use Math::BigFloat;my $i = new Math::BigFloat '1.931533e-01'; 这里用到了Math::BigFloat这个包,就...
在进行数据集处理时,经常会合并两个数据集,这里说一下合并数据集常用的2个函数: 合并列:cbind 合并行:rbind 1.cbind cbind使用非常直观简单。当我们需要直接合并2个矩阵或数据框,不需...
采用TCGAbiolinks 去下载TCGA临床数据,并对数据进行整合
基因大数据挖掘的时代已经到来,您准备好了吗?
在作GSEA的分析时候需要提供一个预先定义好的基因集,用来评估基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势,从而判断其对表型的影响作用,那么基因集都包括哪些呢? GSEA官网的基因集...
命令行特殊字符处理方法
清华大学电子工程学院学生 洪峰
Ka/Ks表示的是非同义替换(Ka)和同义替换(Ks)之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。 同义/非同义突变概念 同义突变表示氨基酸没有改变,氨基酸没...
pubmed按影响因子归类搜索文献
分子生物学
linux
筛选内参基因
在linux上利用awk对数据进行筛选,并输出
Library preparation and Illumina sequencing Genomic DNA from each sample was prepared for libraries construction. The library preparations were sequenced by using an Illumina Hi...
利用EXCEl 绘制热图
利用vi实现文档的搜索替换
例如你有两个基因id文件,你想知道这两个文件共有的id,怎末办呢?一行命令就可以解决。cat 文件1 文件1 |sort|uniq 输出的就是这两个文件的并集cat 文件1 文件1 |sort|uniq ...
三代组装纠错
MEGA进行遗传进化分析,揭示不同种群间遗传进化关系和环境适应性机制。
想做生物信息分析,但不知道怎么入门?先来搭个环境吧!想分析数据,但是分析不了?先来搭个环境啊!搭建好环境,后面的自然就简单多了。 我们平时大都会使用Windows,而很少使用Linux,然而做...