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转录组差异基因为什么要进行聚类分析？

       聚类分析用于判断差异基因在不同实验条件下的表达模式，将表达模式相同或相近的基因聚集成类，进而识别未知基因的功能或已知基因的未知功能，这些同类基因可能具有相似的功能，共同参...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-28 16:28
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如何将GEO芯片注释文件整理成GSEA能使用的芯片注释文件？

将GEO数据库中的注释文件整理成GSEA软件可以使用的芯片注释文件

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  • landy
  • 发布于 2018-06-22 15:01
  • 阅读 ( 8668 )

Excel数据分析技巧之双因素方差分析

>>方差分析之双因素方差分析 小编在节前做过一期使用excel表进行单因素方差分析的推送，反响不错，小编也颇受鼓舞！但是，在许多情况下，单因素方差分析已经不能满足实际分析的需要。比...

TCGAbiolinks 错误 Error in value[[3L]](cond) : GDC server down, try to use this package later

TCGAbiolinks 错误 Error in value[[3L]](cond) : GDC server down, try to use this package later 排查

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-20 09:47
  • 阅读 ( 12698 )

bioperl处理fasta和fastq序列截取反向互补翻译等等

截取，反向互补，读入，写出，筛选等

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-08 15:30
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subset提取符合条件的数据

利用subset针对数据框按照条件进行判断和筛选数据

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-06 21:06
  • 阅读 ( 10393 )

用R做蛋白互作分析

采用R包STRINGdb 来进行蛋白互作网络分析

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-01 16:49
  • 阅读 ( 6286 )

转录组分析基因注释常用的数据库

转录组分析常用数据库

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  • landy
  • 发布于 2018-06-01 13:42
  • 阅读 ( 11435 )

aggregate对数据分组处理

利用aggregate对数据进行分组处理，包括分组求和，分组取均值，最大值，中位数等等

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-31 15:52
  • 阅读 ( 8404 )

密度图--ggplot2

利用ggplot2绘制密度图，并直接在密度图上叠加另一组数据的密度曲线

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-25 13:01
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awk基本参数解释

awk擅长于对文件按行操作，每次读取一行，然后进行相应的操作。 awk读取单个文件时的基本语法格式是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{print $0, $1;}' filename 读取多个文件时的语法是 awk...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-25 10:29
  • 阅读 ( 3185 )

R语言计算平均值，中位数

Mean（）求平均值 通过求出数据集的和再除以求和数的总量得到平均值 函数mean()用于在R语言中计算平均值。语法 用于计算R中的平均值的基本语法是 - mean(x, trim = 0, na.rm = FALSE, ...)...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 15:53
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linux下替换文件中的换行符

之前在linux系统执行以下命令： ls file |xargs sed -i 's/\n//g' 然而却发现没有任何效果，百度之后发现 sed是按行处理文本数据的，每次处理一行数据后，都会在行尾自动添加trailing newline...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 10:35
  • 阅读 ( 6213 )

linux:简单使用（2）

linux

推荐一个好用文献管理软件：CNKI E-Study——数字化学习与研究平台(1)

CNKI E-Study——数字化学习与研究平台的学习使用

R语言、文件读取（2）

R、R语言、文件读取、xlsx

Python虚拟环境解决不兼容问题

采用Python 虚拟环境，解决python不同版本，不同包 间不相容的问题

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-18 10:11
  • 阅读 ( 2515 )

pip安装python模块

python模块安装还是非常简单的，只要把pip安装好之后，一切都用一条命令搞定。 如果你使用的是从 python.org 下载的Python 2 >=2.7.9 或者Python 3 >=3.4，那么pip是已经安装了。 1....

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 09:47
  • 阅读 ( 2088 )

微生物组间差异分析之LEfSe

lefse分析

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-17 21:52
  • 阅读 ( 28590 )

blast序列比对中E值是什么意思？

E value——E（Expect）值，表示随机匹配的可能性。E值越大，随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时，具本上就是完全匹配了 E-value - this tells you the probability of getting this sco...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-17 10:45
  • 阅读 ( 16670 )