安生水
omicsgene
对R包的操作（查询、版本、更新等）
R中对包进行操作的命令很多，涉及从包的安装、查询、更新、卸载等等。这里介绍几个常见的操作
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- Daitoue
- 发布于 2018-10-24 16:01
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Daitoue
microRNA
pheatmap返回的结果解释（获得新的排序信息）
pheatmap是一个热图绘制的R包，全称pretty heatmap。利用的绘图函数是pheatmap()，对应的数据则是一个数值矩阵，譬如基于如下的矩阵10X6： > mat CK-WT-1 CK-WT-2 ...
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- Daitoue
- 发布于 2018-10-19 14:23
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miRTarBase- 一个收录经实验验证的miRNA靶基因数据库
miRTarBase- 一个收录经实验验证的miRNA靶基因数据库
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- microRNA
- 发布于 2018-10-12 16:41
- 阅读 ( 6937 )
网络概念以及Cytoscape导入数据格式理解（ceRNA等多元关系网络数据）
复杂网络(可参考维基百科Complex network、Network theory)由多个基本单元( 或节点) 与它们之间的相互作用( 即连线) 组成,典型的例子有互联网、神经网络和各类生物网络（包括代谢网络、基因调...
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- Daitoue
- 发布于 2018-10-09 14:37
- 阅读 ( 11363 )
ggplot2点图geom_point中点的shape有多少？
ggplot2可以利用geom_point绘制散点图，而点的形状控制参数shape会显示多少效果呢？(注意此处只介绍shape的设定，不是aes(shape)映射） 可以通过查询?shape 获得以下内容： # Shape exampl...
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- Daitoue
- 发布于 2018-09-30 16:59
- 阅读 ( 26346 )
详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息
详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息。
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- 安生水
- 发布于 2018-09-21 13:19
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MeV 绘制热图过程如何对图片颜色做出修改
利用MeV绘制热图，方法可参考： http://www.omicsclass.com/article/263 其中对热图颜色模式进行修改主要在Display中完成，具体可以通过Display-->Color Scheme 进行（见下图）： Gree...
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- Daitoue
- 发布于 2018-09-14 15:57
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meme分析motif结果中，自己序列上的motif序列信息查看
motif分析结果查看，基因上motif的序列信息，
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- omicsgene
- 发布于 2018-09-14 11:53
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Excel图表保存成高清图片
Excel是一款非常强大的电子表格软件，而其图表工具，基本上每一个科研狗都用它画过图。在Excel内，作为矢量图的数据图表可以随意放大缩小，但但是是……作为Excel数据图表没有办法直接保存，更不...
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- Daitoue
- 发布于 2018-09-14 09:43
- 阅读 ( 21929 )
