对R包的操作(查询、版本、更新等)

R中对包进行操作的命令很多,涉及从包的安装、查询、更新、卸载等等。这里介绍几个常见的操作

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-24 16:01
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蛋白质组分析软件MaxQuant

蛋白质组分析软件MaxQuant

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  • microRNA
  • 发布于 2018-10-19 17:01
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pheatmap返回的结果解释(获得新的排序信息)

pheatmap是一个热图绘制的R包,全称pretty heatmap。利用的绘图函数是pheatmap(),对应的数据则是一个数值矩阵,譬如基于如下的矩阵10X6: > mat              CK-WT-1      CK-WT-2     ...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-19 14:23
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miRTarBase- 一个收录经实验验证的miRNA靶基因数据库

miRTarBase- 一个收录经实验验证的miRNA靶基因数据库

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  • microRNA
  • 发布于 2018-10-12 16:41
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mcsan结果文件说明

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-12 13:56
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三个基因组共线性分析

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-12 13:42
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lncRNA调控预测

3种lncRNA互作模式的预测

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  • microRNA
  • 发布于 2018-10-12 11:30
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网络概念以及Cytoscape导入数据格式理解(ceRNA等多元关系网络数据)

复杂网络(可参考维基百科Complex network、Network theory)由多个基本单元( 或节点) 与它们之间的相互作用( 即连线) 组成,典型的例子有互联网、神经网络和各类生物网络(包括代谢网络、基因调...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-09 14:37
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ggplot2点图geom_point中点的shape有多少?

ggplot2可以利用geom_point绘制散点图,而点的形状控制参数shape会显示多少效果呢?(注意此处只介绍shape的设定,不是aes(shape)映射) 可以通过查询?shape 获得以下内容: # Shape exampl...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-09-30 16:59
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hmmsearch寻找相似序列

hmmsearch寻找相似序列

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  • 安生水
  • 发布于 2018-09-30 14:55
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HGMD人类变异数据库ANNOVAR注释使用转换格式

HGMD人类变异数据库ANNOVAR注释使用

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  • 发布于 2018-09-27 16:55
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详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息

详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息。

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  • 发布于 2018-09-21 13:19
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MeV 绘制热图过程如何对图片颜色做出修改

利用MeV绘制热图,方法可参考: http://www.omicsclass.com/article/263   其中对热图颜色模式进行修改主要在Display中完成,具体可以通过Display-->Color Scheme 进行(见下图): Gree...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-09-14 15:57
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iTOL查看进化树中节点ID

iTOL查看进化树中节点ID

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  • 安生水
  • 发布于 2018-09-14 13:30
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meme分析motif结果中,自己序列上的motif序列信息查看

motif分析结果查看,基因上motif的序列信息,

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-09-14 11:53
  • 阅读 ( 34415 )

Excel图表保存成高清图片

Excel是一款非常强大的电子表格软件,而其图表工具,基本上每一个科研狗都用它画过图。在Excel内,作为矢量图的数据图表可以随意放大缩小,但但是是……作为Excel数据图表没有办法直接保存,更不...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-09-14 09:43
  • 阅读 ( 22750 )

ggplot2图例位置legend.position调整

ggplot2绘图过程种,控制图例在图中的位置利用theme(legend.position)参数 该参数对应的设置如下: legend.positionthe position of legends ("none", "left", "right", "bottom", "top", or...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-09-13 18:19
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biolinux导入虚拟电脑失败,报错VBOX_E_FILE_ERROR VirtualBox Machine settings file already exists.

biolinux导入报错问题解决

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-09-12 14:10
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三代全长转录组鉴定红花黄酮类次代物合成相关相关基因-附原文献下载!

三代全长转录组鉴定红花黄酮类次代物合成相关相关基因

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-09-02 21:17
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perl中q,qq,qw的区别

perl中q,qq,qw的区别

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-31 14:28
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