R中对包进行操作的命令很多,涉及从包的安装、查询、更新、卸载等等。这里介绍几个常见的操作
蛋白质组分析软件MaxQuant
pheatmap是一个热图绘制的R包,全称pretty heatmap。利用的绘图函数是pheatmap(),对应的数据则是一个数值矩阵,譬如基于如下的矩阵10X6: > mat CK-WT-1 CK-WT-2 ...
miRTarBase- 一个收录经实验验证的miRNA靶基因数据库
mcsan结果文件说明
三个基因组共线性分析
3种lncRNA互作模式的预测
复杂网络(可参考维基百科Complex network、Network theory)由多个基本单元( 或节点) 与它们之间的相互作用( 即连线) 组成,典型的例子有互联网、神经网络和各类生物网络(包括代谢网络、基因调...
ggplot2可以利用geom_point绘制散点图,而点的形状控制参数shape会显示多少效果呢?(注意此处只介绍shape的设定,不是aes(shape)映射) 可以通过查询?shape 获得以下内容: # Shape exampl...
hmmsearch寻找相似序列
HGMD人类变异数据库ANNOVAR注释使用
详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息。
利用MeV绘制热图,方法可参考: http://www.omicsclass.com/article/263 其中对热图颜色模式进行修改主要在Display中完成,具体可以通过Display-->Color Scheme 进行(见下图): Gree...
iTOL查看进化树中节点ID
motif分析结果查看,基因上motif的序列信息,
Excel是一款非常强大的电子表格软件,而其图表工具,基本上每一个科研狗都用它画过图。在Excel内,作为矢量图的数据图表可以随意放大缩小,但但是是……作为Excel数据图表没有办法直接保存,更不...
ggplot2绘图过程种,控制图例在图中的位置利用theme(legend.position)参数 该参数对应的设置如下: legend.positionthe position of legends ("none", "left", "right", "bottom", "top", or...
三代全长转录组鉴定红花黄酮类次代物合成相关相关基因
perl中q,qq,qw的区别