linux的简单命令(二)

linux常用命令 1:创建文件和和文件 mkdir+yangsm#表示 创建一个yangsm的一个文件夹 vim+yangsm.txt#表示创建一个yangsm.txt的一个文件 2:在vim文件中如何退出 a、Esc b、ctrl+;#可以加...

GFF3格式说明

GFF3格式说明

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 12:01
  • 阅读 ( 10886 )

TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-20 10:58
  • 阅读 ( 14704 )

植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman

你可以对基因进行功能注释,分析其功能分类以及相关的通路信息,你也能分析基因的表达谱数据,但是你知道如何将二者进行结合吗?在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据?有一个工具可以做...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-20 09:18
  • 阅读 ( 15105 )

如何鉴定测序文库是不是链特异性

如何鉴定测序文库是不是链特异性

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-19 13:55
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TCGA中癌症的名称,简写和中文名称

TCGA数据库中含有的癌症名称,简写和中文名称

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-18 22:37
  • 阅读 ( 32839 )

关于Cytoscape利用蛋白质互作网络分析info文件绘制网络图过程中节点String_id转换成GeneID 或者Symbol问题

有学员反映在学习GEO芯片数据挖掘,进行利用差异基因进行蛋白质互作网络分析的过程中,获得的info文件中之涉及了String_id,利用Cytoscape进行绘图的过程中无法知道对应的具体基因ID是什么...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-16 10:26
  • 阅读 ( 8867 )

ggplot2 绘图 离散型颜色选择 ColorBrewer

利用ggplot2绘图 scale_fill_brewer() 或者scale_color_brewer() 会使用到ColorBrewer 配色。可以利用相关的命令查看改配色方案。 library(ggplot2)RColorBrewer::display.brewer.all() 通...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-13 16:53
  • 阅读 ( 5271 )

perl 从数组随机抽取元素

perl中如何随机抽取数组中的一个元素。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-13 13:51
  • 阅读 ( 6271 )

SMB1.0客户端导致的网络驱动器(群辉NAS存储)上的文件无法打开查看编辑等问题(win10)

登陆网络共享存储,找到预处理的文件,结果发现文件打不开,无法编辑,甚至拷贝都出现权限受限问题。但是查看整个权限设置一点问题都没有~~~why? 切换到其他电脑上进行登陆,又没有这个问...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-11 16:36
  • 阅读 ( 7254 )

ActivePerl自带的PPM软件无响应

ActivePerl安装perl模块

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-09 16:41
  • 阅读 ( 6113 )

TCGA数据发表5分文章

TCGA的一篇五分文章

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-06 17:22
  • 阅读 ( 6475 )

小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具

文章投稿,除了文好当然还要“颜好”!在这个看脸的世界,为了给文章加分,各位老师学生也是做足功课了!但是不会编程敲代码?——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-06 09:07
  • 阅读 ( 14061 )

基因ID 转换

生物信息学 基因 ID 转换

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-05 16:08
  • 阅读 ( 6069 )

统计不同分组差异表达结果并统计上下调基因数目并绘制柱状图

R统计不同差异组合,上下调基因个数;并用ggplot2绘制柱状图。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-03 14:02
  • 阅读 ( 11998 )

图片去除大块黑色区域

在使用MEGAN软件绘制分类学树状图时,如果物种较少,生成的图片会有大片的黑色区域,很不美观。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 14:55
  • 阅读 ( 3583 )

植物转录因子调控分析

介绍plantregmap网站的一些分析转录因子的功能

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-29 13:40
  • 阅读 ( 6339 )

单拷贝直系同源基因构建系统发育树以及分歧时间

跨物种研究物种遗传进化方法

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-27 13:06
  • 阅读 ( 12447 )

perl 中glob函数

perl中通过文件操作符glob提供相当于shell中的指定多个文件的“通配符”语法功能,文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-22 14:29
  • 阅读 ( 6350 )

计算串联重复基因KaKs的时候,aln文件一定要通过脚本转换为axt文件么?这两种文件格式是否可以直接通过修改扩展名来实现?

最近有关计算KaKs的输入文件,有人提出了问题,说是不是可以通过修改后缀名称aln变为axt来改变文件,变成软件可识别的格式?答案是不可以的,因为aln文件跟axt文件的格式是不一样的,因此只能通...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-22 12:07
  • 阅读 ( 4736 )