全基因组加倍/复制(whole genome duplication, WGD)
pfam数据库介绍及使用
简便好用的序列提取的perl脚本
搜索鉴定基因的保守结构域,应该用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search,而不是简单的用blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是非常重要的,因为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域!
三元相图查看说明
PCA(principal component analysis )主成分分析,可以分析样品之间相关性,确定样品总体上的差异,或者查看是否有批次效应等
若想要从sam或bam文件中提取指定区域内的reads,可以使用samtools和bedtools来实现。 首先准备一个区域信息文件。region.bed #第一列为染色体ID,第二三列分别为起始终止位置 ...
大牛施一公:如何提高英文的科研写作能力
低成本发一篇sci,你也可以的!!!快来围观吧!
python的pyvcf模块是许多软件的依赖,如cuteSV等,可是直接安装会报错这里可以看出来,pyvcf的安装包竟然还在使用python2编写,因此为了使用它,需要用到use_2to3这个小模块,毫无疑问,这也是...
Clustal Omega是欧洲生物信息研究所(EBI)开发的多序列比对排列工具,现已经完全取代了之前ClustalW的地位。最新本的omega比对准确度更高,而且速度更快,适合大规模的多序列比对。
Domain-结构域分析是研究蛋白功能时不可或缺的分析项,那么如何去预测蛋白的保守结构域呢?以前我们给大家分享过NCBI提供的CD-search工具的使用,详情请点击链接学习:如何正确预测基因的保守结...
cytoscape-cytoHubba插件的安装与使用
上一期给大家介绍了转录组建库原理:转录组扫盲系列--转录组如何建库?建完库下一步就是测序,测序原理讲起来其实很复杂,但是我觉得测序过程少了解一点对于理解转录组数据影响不是很大,下面有...
RDA CCA分析
进化树构建的方法及原理详解
如何将进化树、基因结构以及motif结构在一张图上显示,而不是利用PS去拼图?
总有同学咨询基因家族分析类文章可以投哪些期刊,闲暇之余,小编就整理了一下接收过基因家族分析类文章的期刊,供您投稿时参考! 此Excel包含信息如下:期刊名称、期刊名缩写、影响因子、中科...
CentOS 7 清理删除卸载 Docker 环境