全基因组加倍/复制介绍(whole genome duplication, WGD)

全基因组加倍/复制(whole genome duplication, WGD)

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-02 17:24
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pfam数据库介绍及使用

pfam数据库介绍及使用

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  • 发布于 2019-06-18 11:33
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提取指定基因的fasta序列

简便好用的序列提取的perl脚本

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-27 09:31
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利用NCBI当中的CD-search工具预测基因的保守结构域

搜索鉴定基因的保守结构域,应该用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search,而不是简单的用blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是非常重要的,因为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域!

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-23 12:11
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如何看懂微生物多样性分析当中三元相图ternary

三元相图查看说明

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-13 13:07
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R语言对基因表达量数据RNA-seq做PCA分析

PCA(principal component analysis )主成分分析,可以分析样品之间相关性,确定样品总体上的差异,或者查看是否有批次效应等

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-04 15:21
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提取bam/sam文件指定区域reads

若想要从sam或bam文件中提取指定区域内的reads,可以使用samtools和bedtools来实现。  首先准备一个区域信息文件。region.bed #第一列为染色体ID,第二三列分别为起始终止位置               ...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 09:34
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施一公:如何提高英文的科研写作能力

大牛施一公:如何提高英文的科研写作能力

加权基因共表达网络(WGCNA)寻找与疾病相关的hub基因

低成本发一篇sci,你也可以的!!!快来围观吧!

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 19:22
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pyvcf的安装

python的pyvcf模块是许多软件的依赖,如cuteSV等,可是直接安装会报错这里可以看出来,pyvcf的安装包竟然还在使用python2编写,因此为了使用它,需要用到use_2to3这个小模块,毫无疑问,这也是...

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  • xun
  • 发布于 2023-04-17 15:21
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Clustal Omega多序列比对使用方法(命令行及在线网站)

Clustal Omega是欧洲生物信息研究所(EBI)开发的多序列比对排列工具,现已经完全取代了之前ClustalW的地位。最新本的omega比对准确度更高,而且速度更快,适合大规模的多序列比对。

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  • 星莓
  • 发布于 2022-09-09 14:21
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如何预测蛋白质保守结构域?-InterPro在线工具使用详解

Domain-结构域分析是研究蛋白功能时不可或缺的分析项,那么如何去预测蛋白的保守结构域呢?以前我们给大家分享过NCBI提供的CD-search工具的使用,详情请点击链接学习:如何正确预测基因的保守结...

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  • 红橙子
  • 发布于 2022-01-19 21:53
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cytoscape-cytoHubba插件的安装与使用

cytoscape-cytoHubba插件的安装与使用

转录组扫盲系列--reads如何比对到参考基因组上?

上一期给大家介绍了转录组建库原理:转录组扫盲系列--转录组如何建库?建完库下一步就是测序,测序原理讲起来其实很复杂,但是我觉得测序过程少了解一点对于理解转录组数据影响不是很大,下面有...

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  • 发布于 2021-04-26 19:13
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RDA CCA 分析

RDA CCA分析

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  • 发布于 2020-11-04 22:19
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进化树构建的方法及原理详解

进化树构建的方法及原理详解

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  • 发布于 2020-09-29 16:52
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将进化树+基因结构+motif—1张图全显示

如何将进化树、基因结构以及motif结构在一张图上显示,而不是利用PS去拼图?

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  • babycare
  • 发布于 2020-05-25 14:55
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100个接收基因家族分析类论文的期刊汇总!速领!

总有同学咨询基因家族分析类文章可以投哪些期刊,闲暇之余,小编就整理了一下接收过基因家族分析类文章的期刊,供您投稿时参考! 此Excel包含信息如下:期刊名称、期刊名缩写、影响因子、中科...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-05-25 10:05
  • 阅读 ( 16013 )

CentOS 7 清理删除卸载 Docker 环境

CentOS 7 清理删除卸载 Docker 环境

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  • 发布于 2020-03-11 11:03
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