bcftools创建vcf索引失败
基因定位在动植物研究中非常重要,利用遗传图谱很多科学家定位了重要作物的重要农艺性状,例如克隆水稻分蘖基因 MOC1 的李家洋院士团队,克隆了水稻粒重基因 GW2 的林鸿宣院士团队……,还有数以...
GFF或GTF格式转bed
基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较,以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...
基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较,以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...
在Linux中,0、1和2分别代表标准输入(stdin)、标准输出(stdout)和标准错误输出(stderr)
1. 准备好要提取的染色体及位置信息文件id.list。文件示例如下: Chr1 11787600 11793521Chr1 30028805 30042382Chr1 54966087 54970283Chr1 57228272 ...
alpha_diversity.py -i some.biom -m observed_species,shannon,chao1,simpson,ace,goods_coverage 在运行时报错 File "/share/work/biosoft/python/Python-v2.7.11/lib/python2.7/site-p...
Error in TukeyHSD.aov(., ...) : no factors in the fitted model Calls: %>% ... is.data.frame -> <Anonymous> -> TukeyHSD -> TukeyHSD.aov In addition: Warning mess...
我有12个样本在进行HISAT2比对时有3个样本出现报错(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL) 运行脚本: hisat2 -p 10 --rg-id=L2 --rg SM:L2 --rg LB:L2 --rg PL:ILLUMINA -x iwgsc_re...
遗传图谱构建基础知识
bcftools建索引时报错“染色体区段不连续”
GO富集分析统计表中差异基因数量不一致
在进行韦恩图绘制的时候出现报错: 出现这个报错的原因是在输入数据应当是一个有名字的list,要求是这个list中的每个元素都有名字。 venn <- list(A,B,C)names(venn) <- c("A","B",...
一般情况下,我们笔记本在使用网线连接上网的时候,路由器会自动给你分配一个内网IP。这个IP也是不固定的。 有时候我们会突然遇到连接断网的情况。在排除硬件坏掉情况下,最大原因是自动分配的...
使用fastp软件对fastq文件进行剪切
遗传图绘制代码演示
使用GATK对bam文件进行去重操作的时候发现报错了