单细胞RNA速率(RNA velocity)分析结果解读
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ProteoWizard 是一套用于蛋白质组学数据分析和转换的开源软件工具,它支持多种质谱数据格式转换、可以用于谱图查看、质谱仪器参数查看、还可以用于蛋白序列模拟酶切…… ProteoWizard官网:https...
使用gtfToGenePred的命令和报错: gtfToGenePred -genePredExt Drosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf refFlat.tmp.txtDrosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf (GFF not supported by t...
细胞通讯cellchat结果介绍
单细胞转录组数据挖掘流程记录-BCC 基底细胞癌(GSE123813)
单细胞数据挖掘示例代码
GenePred格式
R markdwon 代码块选项说明:
PERMANOVA(Permutational Multivariate Analysis of Variance)和 ANOSIM(Analysis of Similarities)都是用于分析和比较群组间多元数据差异的统计方法。它们特别适用于生态和环境科学领域,...
序列的提取是我们生物学分析的基础操作,在许多分析中都会使用到。在这里给大家提供几个提取序列的命令。
在人类基因组的广袤海洋中,隐藏着许多生物学上重要的结构,其中之一就是CpG岛。这些富含CpG二核苷酸的DNA序列区域在基因表达调控中扮演着关键角色。然而,要想有效地理解这些岛屿的功能,首先...
QTL定位方法介绍
一款VScode中文档列对齐的插件
shell
在Linux系统中,sed(stream editor)命令是一个非常强大的文本处理工具。它主要用于对文本文件进行过滤和转换操作,支持非交互式的文本编辑。今天,我们就来深入了解一下sed命令的详细使用方法...
TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的,用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb (transcript database)包,有两种构建方式,一...
TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的,用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb (transcript database)包,有两种构建方式,一...
探索基因大数据的利器——SRA Explorer