在运行R时报错缺失libpcre2-8.so.0这个共享库文件
libpcre2-8.so.0是PCRE（Perl Compatible Regular Expressions）库的一个版本，通常用于支持正则表达式。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-04-30 16:14
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每天学习一点点
htop查看程序的io占用
传统的top大家都用的很多,但是top里不会显示磁盘io,而在我们服务器里,磁盘高io往往才是程序运行的瓶颈 新版 的htop新增了io 的查看,读写过高对应选项会变成红色,方便我们查看,除此之外htop还有...
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- xun
- 发布于 2024-04-25 11:03
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xun
NCBI 基因组文件下载——datasets
datasets和dataformat是NCBI的命令行（Command line tools）工具，datasets可以下载ncbi上的生物数据，dataformat可以将metadata数据从json格式转化成其他格式类型。 1. 下载工具 curl -o d...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-04-24 16:52
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Ti Amo
运行useradd -m us001 时报错：Creating mailbox file: File exists
运行useradd -m us001 时报错：Creating mailbox file: File exists
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- 安生水
- 发布于 2024-04-22 14:37
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安生水
omicsgene
linux复制软连接的源文件
直接使用cp拷贝一个软连接,就只能得到一个软连接 但如果有的时候我们需要将软连接指向的文件复制到本地,就可以用到-L参数 其中-L是复制源文件,-l则是创建一个硬链接,注意别用错了
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- xun
- 发布于 2024-04-22 13:20
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R 安装包：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.
R 安装包：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.
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- omicsgene
- 发布于 2024-04-16 15:38
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IF=8.7 | T2T康乃馨基因组揭示了相同基因在不同单倍型基因组中的表达差异
2024年1月 Horticulture Research杂志在线发表了一篇题为“The haplotype-resolved telomere-to-telomere carnation (Dianthus caryophyllus) genome reveals the correlation between genome ar...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-04-15 13:34
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SNP 过滤标准保证数据质量及参考文献：
最近有审稿人问我们的SNP过滤标准的合理解释，这里总结一下相关的参考文献和标准的出处
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- omicsgene
- 发布于 2024-04-12 16:59
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sort: write failed: /tmp/sort0JADkd: No space left on device报错
sort: write failed: /tmp/sort0JADkd: No space left on device报错
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- 安生水
- 发布于 2024-04-12 10:29
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利用vcftools分析玉米和大刍草基因组区域或基因区域是否受到选择
通过已经发表的玉米和大刍草基因组变异数据来计算感兴趣的基因组位置上，是否受到选择。主要是比较大刍草和玉米之间，该区间的多样性是否会下降，如果该区域内SNP的多态性下降，表明该区域内受到了选择。
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- 每天进步一点点
- 发布于 2024-04-04 10:59
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每天进步一点点
转录组个性化分析之可变剪切分析工具：rMATS turbo
转录组个性化分析之可变剪切分析工具：rMATS turbo
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- 安生水
- 发布于 2024-04-01 11:36
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svg2xxx运行报错
/share/work/biosoft/tools/distributing_svg_4.74/svg2xxx_release/svg2xxx all.KEGG.svg ./ -dpi 300 Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedOperationException: The Security Ma...
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- xun
- 发布于 2024-03-26 11:31
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一些常见R代码的报错和解决办法
Error: cannot allocate vector of size X Gb 这种问题尤其在32位R版本中常见，因为它们对可用内存有限制。即使在64位版本中，当数据集非常大时也可能遇到内存问题。解决这个问题通常需要优化...
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- xun
- 发布于 2024-03-25 14:39
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GATK 4.4.0报错“ A JNI error has occurred, please check your installation and try again”
报错 在利用GATK进行markdup和variant calling的时候出现报错： 报错的主要信息用红框框出了，错误信息是：错误为发生JNI错误，请检查安装并重试。 出现报错的原因： 1. javac与java版本...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-03-25 11:54
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