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关于基因家族课程中基因在染色体上位置提取不到问题分析

网易云基因家族课程中，在提取基因在染色体上的位置信息使用到的是一个脚本，大家经常的遇到一个问题就是没有提取出来信息。 下面是可能存在的问题之一： 脚本在处理信息时与gff文件的匹...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-08 10:39
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排序分析PCA、PCoA、CA、NMDS、RDA、CCA等区别与联系

降维排序分析方法包括：PCA、PCOA、CA、DCA、NMDS、RDA、CCA等等还有很多，理解他们的区别与联系才能熟练运用。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-29 13:00
  • 阅读 ( 37682 )

GEO数据库之芯片数据下载

教你利用GEOquery并结合Biobase下载GEO数据库多种数据，轻松数据下载与整理。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-25 13:45
  • 阅读 ( 10149 )

read.xlsx读取Excel文件

利用“xlxs"读取真Excel文件中的内容

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-25 13:28
  • 阅读 ( 8142 )

如何正确选择差异统计检验

对于科学问题，我们常常要找到差异，需要用到统计学检验，但是那么多统计学检验我该如何选择呢？

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-24 17:51
  • 阅读 ( 11308 )

组学大讲堂视频课程

组学大讲堂视频课程

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-22 13:04
  • 阅读 ( 20887 )

分组柱状图--ggplot2

利用ggplot2绘制分组柱状图，并进行标签图例等设置。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-10 17:10
  • 阅读 ( 27463 )

正选择分析之 Site Models

作为常用的正选择分析方法，计算Ka/Ks方法较为严格。本文介绍利用Sites Model方法来分析正选择基因。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 10:39
  • 阅读 ( 13732 )

地球上物种总数到底有多少？？

时至今日，人类对生物总数还是没有明确的认识，本文介绍了多位科学家在生物总数评估上做出的成果。

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  • omics007
  • 发布于 2018-04-21 17:31
  • 阅读 ( 16039 )

5分钟看懂KEGG代谢通路图

ko、map等开头的代谢图有啥区别？里面的点、线、不同颜色都代表什么含义？看完这篇就懂啦！

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 21:41
  • 阅读 ( 23410 )

pyvcf的安装

python的pyvcf模块是许多软件的依赖，如cuteSV等，可是直接安装会报错这里可以看出来，pyvcf的安装包竟然还在使用python2编写，因此为了使用它，需要用到use_2to3这个小模块，毫无疑问，这也是...

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  • xun
  • 发布于 2023-04-17 15:21
  • 阅读 ( 1711 )

NCBI下载SRR并转换为fastq文件

想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据，看了一些下载教程，方法各异，看完思路还是不清晰，以下记录我的操作步骤，仅供参考

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  • 星莓
  • 发布于 2022-12-09 11:56
  • 阅读 ( 8293 )

进化树美化操作详解- iTOL

绘制进化树，是科研人的基础技能之一，而一张好看的进化树图，不仅能直观得展现基因或物种间的发育进化关系，更能增加文章的观赏性，赢得审稿人的青睐。今天给大家介绍的是一款非常实用且操作简...

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  • rzx
  • 发布于 2022-10-12 15:53
  • 阅读 ( 18165 )

mapman非模式植物基因注释时遇到的问题

解决老牌植物软件mapman出图的bincode与图上的binname不匹配

Clustal Omega多序列比对使用方法（命令行及在线网站）

Clustal Omega是欧洲生物信息研究所（EBI）开发的多序列比对排列工具，现已经完全取代了之前ClustalW的地位。最新本的omega比对准确度更高，而且速度更快，适合大规模的多序列比对。

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  • 星莓
  • 发布于 2022-09-09 14:21
  • 阅读 ( 27016 )

如何预测蛋白质保守结构域？-InterPro在线工具使用详解

Domain-结构域分析是研究蛋白功能时不可或缺的分析项，那么如何去预测蛋白的保守结构域呢？以前我们给大家分享过NCBI提供的CD-search工具的使用，详情请点击链接学习：如何正确预测基因的保守结...

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  • 红橙子
  • 发布于 2022-01-19 21:53
  • 阅读 ( 33740 )

生物导航——专为生命科学工作者定制的浏览器首页！

浏览器是科研工作者每天都要频繁使用的重要工具，但很多老师、同学的浏览器首页却仍是一个充满广告的、乱糟糟的网站。 为什么不能有这么一个网站？它提供文献检索、科研工作、生信分析常用的网址，同时页面简洁、美观、没有广告，专门为生命科学工作者定制！

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  • omics007
  • 发布于 2021-04-19 10:00
  • 阅读 ( 6600 )

RDA CCA 分析

RDA CCA分析

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  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-04 22:19
  • 阅读 ( 13144 )

送你一个小巧好用的序列分析软件-APE-功能强大，操作简单！

APE是一款序列分析软件，可以对序列进行酶切位点预测、序列比对、引物设计、DNA序列翻译等等，用途是十分广泛，APE软件小巧快速，操作简单，下面我们一起了解一下它的功能！ 1. 酶切位点预测...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-06-29 11:58
  • 阅读 ( 14858 )

转录组结果解读及分析技巧

已经测了转录组，或者计划做转录组，但又担心写不出来文章？一站式解决转录组难题，趁开学前投稿吧！

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  • omics007
  • 发布于 2020-05-18 14:01
  • 阅读 ( 14671 )