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使用Python jcvi 时遇到的报错 ，如：FileNotFoundError，如何解决
关于JCVI的使用，唐老师在github上已经有很详细的介绍，网络上也有很多教程。JCVI依赖的东西非常多，因此在使用时还是难免遇到各种问题，以在使用Python JCVI，遇到FileNotFoundError为例，...
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- 生信阿姨
- 发布于 2023-04-18 11:35
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生信阿姨
安生水
Linux的shuf命令对文件的行进行随机排序
Linux常用命令shuf用于把输入行按随机顺序输出到标准输出。 具体用法如下： shuf命令会将final.bed文件中的所有行随机排序，-n选项设置显示前1000行。 常用参数有： 示例： 生成3个...
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- 安生水
- 发布于 2023-04-17 10:09
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压缩或解压软链接文件，gzip或gunzip报错Too many levels of symbolic links
目录下有个软链接的文件，想对它进行压缩或者解压，但是却报错Too many levels of symbolic links
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- 星莓
- 发布于 2023-04-14 15:20
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星莓
rzx
gff文件格式不标准的修改脚本
gff文件第三列一般有gene，mRNA，CDS，exon等等信息，但是有时候我们下载的gff文件没有gene信息，只有mRNA等等的信息，我们可以实用脚本手动校正。
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- 星莓
- 发布于 2023-04-07 16:02
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解决Rstudio Server卡顿问题
在使用Rstudio Server出现卡顿，或者每次打开server都会加载之前的工作。 解决方法： 1. 清除工作区内项目信息 2. 在Termianal页面下删除session rm -rf ~/.local/share/rstudio/sessions...
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- rzx
- 发布于 2023-04-07 15:39
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xun
conda一直卡在Solving environment
在使用conda安装CARD数据库自带软件rgi的时候，发现一直卡在Solving environment这一步，查了不少攻略也没能解决问题， 结果换了mamba后瞬间就安装上了，安装非常方便 conda install mamba -c...
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- xun
- 发布于 2023-04-06 16:37
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dQTL.seq方法研究基因定位
dQTG.seq方法包含dQTG.seq1、dQTG.seq2、smoothLOD、C'、Δsnp index、ED六种计算方法。 其中dQTG-seq1方法利用F2群体极端池标记等位基因数目来预测其基因型数目，通过观测的标记等位基因数目和...
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- rzx
- 发布于 2023-03-29 11:56
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R语言数据整理——tidyr包
tidyr主要提供了一个类似Excel中数据透视表(pivot table)的功能 tidyr包主要涉及： 1)长宽数据转换；2)列分割与列合并；3)缺失值的简单补齐
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- 星莓
- 发布于 2023-03-24 15:57
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