ERROR 1290 (HY000): The MySQL server is running with the --skip-grant-tables 解决方法

ERROR 1290 (HY000): The MySQL server is running with the --skip-grant-tables 解决方法

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2022-12-12 14:49
  • 阅读 ( 1834 )

pfam数据库被合并之后,还有很多数据库可以进行结构域的查询

pfam数据库被合并之后,还有很多数据库可以进行结构域的查询

零假设与备择假设

零假设(null hypothesis),统计学术语,又称原假设,指进行统计检验时预先建立的假设,这个假设一般是未进行实验之前最保守和有意推翻的假设,而之后实验的目的一般是希望证明其假设错误。 零...

  • 0
  • 0
  • rzx
  • 发布于 2022-12-09 15:23
  • 阅读 ( 4524 )

repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件,可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽

repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件,可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-12-07 10:13
  • 阅读 ( 2578 )

pip报错

出现报错WARNING: Running pip as the 'root' user can result in broken permissions and conflicting behaviour with the system package manager. It is recommended to use a virtual envir...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2022-12-05 16:42
  • 阅读 ( 3080 )

MySQL报错:ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock'

MySQL报错:ERROR 2002 (HY000)

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2022-12-05 14:09
  • 阅读 ( 2490 )

添加千位分隔符

添加千位分隔符

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2022-12-05 14:02
  • 阅读 ( 1470 )

超大基因组,超长染色体,凤丹牡丹基因组怎一个难字了得!

上海辰山植物园联合中科院植物研究所、中科院分子植物卓越中心在NC发文公布凤丹牡丹基因组及其关键性状的分子基础!

  • 0
  • 0
  • omics007
  • 发布于 2022-11-30 15:10
  • 阅读 ( 2747 )

真菌 ncRNA 基因特征及坚定方法

Haas BJ, Zeng Q, Pearson MD, Cuomo CA, Wortman JR. Approaches to Fungal Genome Annotation. Mycology. 2011 Oct 3;2(3):118-141. doi: 10.1080/21501203.2011.606851. PMID: 22059117; PMCID: PMC3207268.

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-30 14:07
  • 阅读 ( 931 )

uniref50 数据库下载及格式化

uniref50 数据库下载及格式化

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-29 10:42
  • 阅读 ( 2377 )

singularity运行fastqc报错OutOfMemoryError

比如在singularity中运行: singularity exec /share/singularity_images/reseq_v1.2.sif fastqc $datadir/*.gz  -o $workdir/1.fastqc 可能报错: 可以加一个-t选项,多线程运行,如下图,...

blastp 快速比对注释基因,输出注释信息

blastp -query unknown.pep.fa -db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta -num_threads 10  -evalue 0.000001 -seg yes -soft_masking true -lcase_masking -max_hsps 1...

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-21 16:35
  • 阅读 ( 1421 )

Pheatmap绘制多分组热图

Pheatmap绘制多分组热图

名额有限-组学大讲堂共享云服务器开售了!

组学大讲堂云共享服务器上线!

contig or scaffold GFF 文件通过AGP文件转换成 染色体 gff文件

contig GFF 文件通过AGP文件转换成 染色体 gff文件

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-17 21:14
  • 阅读 ( 1924 )

组装好的基因组通过agp文件得到contig序列

https://github.com/tanghaibao/jcvi/issues/391

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-17 20:33
  • 阅读 ( 2429 )

Mac使用FileZilla连接服务器-SSH

Mac使用FileZilla连接服务器-SSH

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-17 12:11
  • 阅读 ( 1943 )

eggNOG 注注释报near "WITHOUT": syntax error

eggnog-mapper 注释

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-16 15:44
  • 阅读 ( 2032 )

duplicate_gene_classifier统计全基因组不同类型复制事件的数目

duplicate_gene_classifier属于MCScanX的核心程序,用于基因分类,统计全基因组不同类型复制事件的数目。 命令行格式: $duplicate_gene_classifier Dl Dl是物种缩写,是Dl.blast文件。在运...

  • 0
  • 0
  • rzx
  • 发布于 2022-11-16 14:00
  • 阅读 ( 3820 )