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核苷酸多样性π的计算

核苷酸多样性（nucleotide diversity），记为π，是分子遗传学中一个重要的概念，可以作为一个群体遗传的重要指标去衡量种群的遗传多样度水平，也可以用在单个基因的多序列比对之中找到受选择的...

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给进化树标定化石时间

进化树（Phylogenetic Tree）是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中，每个分支点（节点）代表一个共同祖先，而每个末端的分支（叶节点）代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间，即在进化树上标注时间点，为进化树提供了一个时间框架，便于超度量树的构建

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-07-10 17:43
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LD衰减距离

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  • 安生水
  • 发布于 2024-06-27 09:50
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tassel PCA报错

tassel 跑PCA的时候由于SNP位点太多报错

遗传图绘制：

遗传图绘制代码演示

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  • 发布于 2024-02-22 15:59
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docker 镜像 中plink 出现报错 segmentation fault

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  • 发布于 2022-11-11 13:10
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主成分分析（PCA）如何计算方差解释率

我们常看到的PCA图中，每个成分都对应了每个特征方差贡献率。通常，求得了PCA降维后的特征向量，我们就可以绘图，但各个维度的方差解释率没有得到，就无法获得PC坐标的百分比。 （文...

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  • 发布于 2022-09-02 11:05
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群体进化选择消除分析

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  • 发布于 2021-09-09 17:00
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i遗传进化

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  • 发布于 2021-09-02 18:00
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群体遗传进化PCA分析

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群体遗传进化进化树分析方法：

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连锁不平衡原理与计算（LD）

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  • 发布于 2020-11-12 14:25
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群体结构分析structure原理

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重测序群体遗传进化分析之—进化树构建

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  • 发布于 2020-10-14 15:03
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GCTA 分析PCA

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进化树构建的方法及原理详解

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群体遗传进化名词解释

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同源基因概念（直系同源 vs旁系同源 ）

分子进化与系统发生同源基因

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进化树构建方法及原理

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  • 发布于 2020-09-28 15:50
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使用XP-CLR检测基因组中的选择信号

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  • 发布于 2020-09-28 14:21
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