GSEA法基因功能富集分析原理详解！
在组学大讲堂之前的一篇微信文章：关注的功能基因集在转录组结果中表现如何？中，跟大家介绍了GSEA（Gene Set Enrichment Analysis）及其分析结果。GSEA是一种基于基因集的富集分析方法，在对...
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- landy
- 发布于 2018-06-25 18:16
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landy
生信阿姨
全基因组加倍/复制介绍（whole genome duplication, WGD）
全基因组加倍/复制（whole genome duplication, WGD）
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- omicsgene
- 发布于 2023-03-02 17:24
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omicsgene
已知目标基因，如何进行局部共线性绘图？
在日常的生信分析中，通过一些组学分析策略我们能够得到与某一物种性状紧密关联的候选基因。在此情况下，如果我们想要对候选基因在其他物种中的同源基因进行查找，或者在染色体上对这些基因进行定位，那么就需要进行物种间基因座的局部共线性可视化(Microsynteny visualization)。今天我们就来教大家使用jcvi软件包中的子程序MCscan(Python version)进行物种间基因组的局部共线性绘图。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2023-09-14 11:29
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每天学习一点点
smyang2018
必须收藏！比较基因组学分析必备神器-OrthoVenn2
全基因组直系同源基因簇（Orthologousclusters）的分析是比较基因组学研究中的一项重要内容，直系同源基因簇之间的聚类及网络构建有助于解释跨多物种的蛋白质的功能和进化关系，今天小编给大家...
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- 红橙子
- 发布于 2020-12-05 21:12
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红橙子
如何利用NCBI提取特定位置的基因组序列？
小编经常遇到这样的一些个性化分析，例如，下载某物种某染色体XXXX-XXXX碱基区域内的全部基因信息，尤其是BSA、QTL定位、GWAS等项目客户，该类需求是很多的；之前给大家分享过一个利用Ensembl数...
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- 红橙子
- 发布于 2020-03-17 14:20
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生信老顽童
omics007
组装"预实验" | 物种倍性分析
倍性直接影响基因组的大小和复杂性，不同倍性的物种需要不同的组装策略，了解物种的倍性对于基因组组装至关重要
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- Ti Amo
- 发布于 2024-11-25 15:22
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Ti Amo
组装"预实验" | 基因组调研图
基因组调研图有助于了解即将组装的这个物种的基因组复杂程度，为后续的正式的基因组组装去提供一些依据。基因组的复杂程度可以从基因组大小，倍性，杂合度，重复率等方面去进行评价。 用什么来...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-07-30 15:39
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