linux中sed 替换

linux中sed 替换用法

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-31 14:11
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linux-列合并

linux中cat命令可以按行合并多个文件,而按列合并多个文件也是可以的。用到的命令是paste。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-24 15:41
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linux 重定向

linux 重定向

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-24 15:13
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CentOS linux的环境变量配置

CentOS linux的环境变量配置

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-24 09:29
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UbuntuLinux系统环境变量配置

UbuntuLinux系统环境变量配置

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-23 22:56
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利用sed 命令去掉windows下回车符

在Windows中文件的换行符与linux中是不同的,其在linux中显示为^M,在使用脚本处理时并不希望有这个符号,所以需要去掉此符号,其方法如下: sed  -i 's/^M//g'  test.txt    ^M 是回车换行符...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-23 18:22
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linux中字符串截取

linux字符串截取

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-20 10:54
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linux 从文件中随机抽取部分数据

如何从某一个文本文件中随机抽取一部分数据。譬如右下方这样的基因表达量数据的统计文件ref_trans_full_table.xls目标是由此文件中随机抽取一部分数据。 可以利用shuf获取随机数据,譬如随机...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-31 17:04
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linux的简单命令(二)

linux常用命令 1:创建文件和和文件 mkdir+yangsm#表示 创建一个yangsm的一个文件夹 vim+yangsm.txt#表示创建一个yangsm.txt的一个文件 2:在vim文件中如何退出 a、Esc b、ctrl+;#可以加...

biolinux共享目录文件夹建立及注意事项

biolinux共享目录创建及注意事项。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-05 18:38
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linux处理fasta和fastq序列

linux命令处理fasta序列

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-21 22:46
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linux下解压命令

在下载或上传文件时,会碰到很多压缩文件,种类较多,这里就介绍一下各种常见类型的文件如何压缩以及解压缩

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-14 17:44
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fastq文件查看指定序列

在处理fastq文件时,可能会遇到序列与质量值长度不一致或格式不正确等问题,这时候软件会报告哪条序列有问题,并给出序列ID,然后我们就要去查看这条序列是什么问题。但是,fastq文件通常是很大的,使用less命令可能很难搜索到

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-08 11:48
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Bio-Linux中的生物信息学软件

Bio-Linux中有很多安装的生物信息学软件,这里给大家列举一下:

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-06 17:49
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linux系统中ls命令的常用用

ls命令是linux下最常用的命令。ls命令就是list的缩写,缺省下ls用来打印出当前目录的清单,如果ls指定其他目录,那么就会显示指定目录里的文件及文件夹清单。通过ls 命令不仅可以查看linux文件夹...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-01 13:18
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linux 命令当中出现特殊字符无法传递参数怎么办

命令行特殊字符处理方法

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-31 11:03
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awk基本参数解释

awk擅长于对文件按行操作,每次读取一行,然后进行相应的操作。 awk读取单个文件时的基本语法格式是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{print $0, $1;}' filename 读取多个文件时的语法是 awk...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-25 10:29
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awk筛选差异基因

命令行筛选差异基因

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  • landy
  • 发布于 2018-05-24 18:03
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linux下替换文件中的换行符

之前在linux系统执行以下命令: ls file |xargs sed -i 's/\n//g' 然而却发现没有任何效果,百度之后发现 sed是按行处理文本数据的,每次处理一行数据后,都会在行尾自动添加trailing newline...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 10:35
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linux:简单使用(2)

linux