fastq文件查看指定序列

在处理fastq文件时,可能会遇到序列与质量值长度不一致或格式不正确等问题,这时候软件会报告哪条序列有问题,并给出序列ID,然后我们就要去查看这条序列是什么问题。但是,fastq文件通常是很大的,使用less命令可能很难搜索到

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-08 11:48
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Bio-Linux中的生物信息学软件

Bio-Linux中有很多安装的生物信息学软件,这里给大家列举一下:

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-06 17:49
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linux系统中ls命令的常用用

ls命令是linux下最常用的命令。ls命令就是list的缩写,缺省下ls用来打印出当前目录的清单,如果ls指定其他目录,那么就会显示指定目录里的文件及文件夹清单。通过ls 命令不仅可以查看linux文件夹...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-01 13:18
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linux 命令当中出现特殊字符无法传递参数怎么办

命令行特殊字符处理方法

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-31 11:03
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awk基本参数解释

awk擅长于对文件按行操作,每次读取一行,然后进行相应的操作。 awk读取单个文件时的基本语法格式是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{print $0, $1;}' filename 读取多个文件时的语法是 awk...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-25 10:29
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awk筛选差异基因

命令行筛选差异基因

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  • landy
  • 发布于 2018-05-24 18:03
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linux下替换文件中的换行符

之前在linux系统执行以下命令: ls file |xargs sed -i 's/\n//g' 然而却发现没有任何效果,百度之后发现 sed是按行处理文本数据的,每次处理一行数据后,都会在行尾自动添加trailing newline...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 10:35
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linux:简单使用(2)

linux

linux的简单命令(一)

linux

linux常用命令整理之文件解压缩:

linux常用命令整理之文件解压缩:tar命令:解压:tar xvf FileName.tar压缩:tar cvf FileName.tar DirName gz命令解压:gunzip FileName.gz压缩:gzip FileName zip命令解压:unzip File...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-18 13:03
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awk 判断并筛选数据

在linux上利用awk对数据进行筛选,并输出

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-17 09:41
  • 阅读 ( 7832 )

vi基本替换

利用vi实现文档的搜索替换

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-11 15:52
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linux命令如何对两个文件去重复

例如你有两个基因id文件,你想知道这两个文件共有的id,怎末办呢?一行命令就可以解决。cat     文件1  文件1  |sort|uniq    输出的就是这两个文件的并集cat     文件1  文件1  |sort|uniq   ...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-11 13:54
  • 阅读 ( 2534 )

biolinux 挂载虚拟目录注意事项

biolinux

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-27 23:13
  • 阅读 ( 3938 )

biolinux 虚拟机内存不能为written怎么解决

biolinux虚拟机导入之后打开报错

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-27 21:27
  • 阅读 ( 5710 )

biolinux虚拟机不能为虚拟机打开一个新任务,或者一直黑屏解决办法

biolinux打不开

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-27 08:57
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Linux生物信息分析环境搭建

想做生物信息分析,但不知道怎么入门?先来搭个环境吧!想分析数据,但是分析不了?先来搭个环境啊!搭建好环境,后面的自然就简单多了。 我们平时大都会使用Windows,而很少使用Linux,然而做...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 23:08
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为什么做生物信息分析需要学会linux

Linux系统生物信息分析必备利器。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:48
  • 阅读 ( 11304 )

一条命令能解决多少数据处理问题?

继Linux生信入门,我们又出新课程啦!本期课程我们讲的是Linux命令的使用及怎么用来处理生物数据。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 11:11
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