Morii
生成OTU方法如何选择，OTU/ASV?
微生物多样性分析中最重要的就是OTU特征表，一切后续分析都围绕OTU表来进行。生成OTU除了聚类的方法，还有降噪的方法
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- Morii
- 发布于 2020-09-17 14:37
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微生物群落功能注释-FAPROTAX数据库介绍及使用
微生物多样性分析中，常常需要对微生物群落功能进行注释，FAPROTAX数据库方便简单效果好，一行代码即可生成功能注释表，今天就给大家介绍该数据库内容及使用方法。 FAPROTAX数据库简介 1. FAP...
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- Morii
- 发布于 2020-09-17 14:20
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omicsgene
排序分析PCA、PCoA、CA、NMDS、RDA、CCA等区别与联系
降维排序分析方法包括：PCA、PCOA、CA、DCA、NMDS、RDA、CCA等等还有很多，理解他们的区别与联系才能熟练运用。
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- omicsgene
- 发布于 2018-05-29 13:00
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如何正确选择差异统计检验
对于科学问题，我们常常要找到差异，需要用到统计学检验，但是那么多统计学检验我该如何选择呢？
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- omicsgene
- 发布于 2018-05-24 17:51
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beta多样性中的距离矩阵总结
距离矩阵差别：jaccard bray-curtis 欧式距离 unifrac（weighted/unweigted）
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- omicsgene
- 发布于 2018-05-24 13:20
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微生物多样性分析之Bray curtis距离
Bray-Curtis距离是以该统计指标的提出者J. Roger Bray和John T. Curtis的名字命名的主要基于OTUs的计数统计比较两个群落微生物的组成差异。与unifrac距离包含的信息完全不一样相比于jaccard距...
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- 安生水
- 发布于 2018-05-18 09:21
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安生水
OTU互作网络分析用MENA
MENA，一个可以利用OTU数据进行在线分子生态网络分析的网站，帮你搞定OTU互作网络图。
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- Daitoue
- 发布于 2018-04-22 21:19
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Daitoue
做微生物研究必懂的OTU table相关知识
微生物多样性分析中最基础、最重要的文件为OTU table，因此理解OTU table的含义和来路，对微生物多样性分析至关重要。本文介绍OTU table是怎么样一步一步得来的，及其注意事项。
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-20 19:53
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