基于perl 提取基因家族内的串联重复基因对

基于perl 提取基因家族内的串联重复基因对

  • 2
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-31 10:27
  • 阅读 ( 9052 )

perl 中 grep 的使用

perl 中 grep 的使用

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-08-17 12:10
  • 阅读 ( 2705 )

perl 中 $#ARGV 是什么意思

perl 中 $#ARGV 是什么意思

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-08-17 10:37
  • 阅读 ( 5580 )

perl中对数组字符串取交集,并集,差集包

Array::Utils ,perl中对两个数据取交集,并集 差集等等,union,intersect,diff等操作

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-06 17:51
  • 阅读 ( 5242 )

perl中读取和写出Excel的包,xls,和xlsx

介绍两个perl中的包,分别可以读取Excel的文件,包括2003 的xls文件,和2007的xlsx的文件。Spreadsheet::ParseExcel; Spreadsheet::ParseXLSX;

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-05 16:59
  • 阅读 ( 13060 )

miRNA与靶基因相关性作图

miRNA与靶基因相关性作图

  • 1
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-08-03 13:02
  • 阅读 ( 8443 )

提取miRNA前后500bp序列

在没有位置信息时,提取miRNA前后500bp的序列

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-08-03 11:44
  • 阅读 ( 2975 )

perl脚本批量生成反向互补序列

有时候我们需要得到序列的反向互补序列,可以用下面的脚本来批量处理序列。

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-08-02 17:14
  • 阅读 ( 5508 )

从MEGA进化树分析结果nwk文件提取基因ID

从nwk文件中提取基因ID

  • 1
  • 1
  • 安生水
  • 发布于 2018-07-27 14:38
  • 阅读 ( 9296 )

2维韦恩图各部分基因上下调数量统计

2维韦恩图各部分基因上下调数量统计

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-07-27 11:34
  • 阅读 ( 4384 )

提取指定基因的fasta序列

简便好用的序列提取的perl脚本

  • 1
  • 6
  • 安生水
  • 发布于 2018-07-27 09:31
  • 阅读 ( 9051 )

perl中的正则表达式

perl中的正则表达式

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-20 15:00
  • 阅读 ( 2454 )

从Windows粘贴到linux的内容行尾会有东西?

将Windows中该文件的内容粘贴复制到linux文件中,用perl读取并保存到哈希中,然后读取另一文件的第一行,判断他第一列的内容是否在上一个文件中存在,结果总是不存在,然而明明就在啊,怎么会不存在呢,一遍遍检查代码也找不到问题。到底为什么呢?

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-07-13 15:14
  • 阅读 ( 1747 )

perl 从数组随机抽取元素

perl中如何随机抽取数组中的一个元素。

  • 0
  • 1
  • 安生水
  • 发布于 2018-07-13 13:51
  • 阅读 ( 6117 )

ActivePerl自带的PPM软件无响应

ActivePerl安装perl模块

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-09 16:41
  • 阅读 ( 5923 )

perl语言——正则表达式

正则表达式(regular expression)描述了一种字符串匹配的模式,可以用来检查一个串是否含有某种子串、将匹配的子串做替换或者从某个串中取出符合某个条件的子串等。 Perl语言的正则表达式功能非...

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 14:32
  • 阅读 ( 2698 )

提取基因组所有基因的启动子序列

有时候们会需要基因的启动子序列,这里有脚本可以提取基因组所有基因的启动子序列。

  • 4
  • 2
  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 12:56
  • 阅读 ( 9896 )

SNP2CAPS使用

SNP2CAPS可将SNP转换为CAPS标记,其具体用法: perl SNP2CAPS.pl   chr5D:9950377.fa_1    link_gcg    AanI,AarI,AasI,AatII,Aba6411II,AbaB8342IV,AbaCIII   > chr5D:9950377.txt 其中...

  • 1
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-06-22 15:44
  • 阅读 ( 3815 )

merged.gtf 合并同一转录本的exon位置

在merged.gtf文件中有所有外显子的信息,下面的脚本可根据此文件提取转录本的所有外显子位置信息。 merged.gtf文件实例: Chr00   Cufflinks       exon    37990   38333   .       +      ...

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-06-22 15:09
  • 阅读 ( 5168 )

perl 中glob函数

perl中通过文件操作符glob提供相当于shell中的指定多个文件的“通配符”语法功能,文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。

  • 0
  • 1
  • 安生水
  • 发布于 2018-06-22 14:29
  • 阅读 ( 6209 )