SNP 过滤标准保证数据质量及参考文献：
最近有审稿人问我们的SNP过滤标准的合理解释，这里总结一下相关的参考文献和标准的出处
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- omicsgene
- 发布于 2024-04-12 16:59
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omicsgene
bcftools建索引报错：Chromosome blocks not continuous
bcftools建索引时报错“染色体区段不连续”
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-03-04 11:46
- 阅读 ( 1004 )
每天学习一点点
老师您好，请问在群体遗传进化中，模板数据黄瓜的分组，sample 是指的什么？是测序数据下机的样品编号？
不太理解就是当所有的下机数据合并成vcf文件，后续需要建树和扫描清除分析时应该怎么填写分组txt？
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- shidandan
- 发布于 2023-11-02 09:41
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shidandan
多款软件进行vcf合并--gatk、vcftools、bcftools
链接：https://www.jianshu.com/p/116c8e4c93f4
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- 星莓
- 发布于 2022-09-21 18:00
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星莓
vcf文件annovar的注释结果绘制瀑布图maftools分析
vcf文件annovar的注释结果绘制瀑布图maftools分析
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- omicsgene
- 发布于 2022-01-04 13:04
- 阅读 ( 3894 )
BSA分析中MutMap 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的
BSA分析中MutMap 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的
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- omicsgene
- 发布于 2020-07-21 13:02
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BSA分析中QTL-seq 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的
BSA分析中QTL-seq 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的
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- omicsgene
- 发布于 2020-07-21 12:51
- 阅读 ( 5012 )
GATK Hard-filter 过滤变异结果推荐阈值
GATK Hard-filter 过滤变异结果推荐阈值
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- omicsgene
- 发布于 2020-06-25 09:38
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BSA分析算法中的ED算法和SNP-index有什么区别？
ED和snp-index是进行BSA基因定位时最常用的算法，本文简述了两者的区别。
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- omics007
- 发布于 2019-08-02 12:30
- 阅读 ( 17868 )
omics007
外显子测序发现遗传性NK/T细胞淋巴瘤癌与FAM160A1基因突变相关
外显子测序发现遗传性NK/T细胞淋巴瘤与FAM160A1基因突变相关
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- omicsgene
- 发布于 2019-05-24 16:55
- 阅读 ( 3224 )
