大家好啊,新手一枚,请多关照哈、
1. 寻找前体:将reads比对到参考基因组上。得到fa文件:对输入reads信息重新整理(将不同样本的reads重新整合到一起);arf文件:比对结果。如果想增加比对结果,可以增加参数-q(比对错配数为1...
1. 寻找前体:将reads比对到参考基因组上。得到fa文件:对输入reads信息重新整理(将不同样本的reads重新整合到一起);arf文件:比对结果。如果想增加比对结果,可以增加参数-q(比对错配数为1...
什么是siRNA ? siRNA(small interfering RNA 小干扰RNA) 是由 20-25 个核苷酸组成的双链 RNA 分子。一般3’端有两个游离的碱基,通过RNA干扰途径沉默目标基因。 RNA干扰(RNAi) 在RNA干扰...
运行命令:Rhi_mature.fa 是物种miRNA成熟序列;Rhi_hairpin.fa 是物种miRNA前体序列; perl otal_reads_collapsed_vs_genome.arf none -d -g 100000 -l 500 -m 11 -v -P -n d 报错: T...
miRNA合成过程,以及miRNA命名方式,编号规则
一、miRNA的定义 miRNA(microRNA)是一组由基因组编码的长度约20~23个核苷酸的非编码RNA,通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或阻碍其翻译。 miRNA在物种进化中相当保守,...
miRTarBase- 一个收录经实验验证的miRNA靶基因数据库
miRWalk: 一个预测人类miRNA靶基因的网站