vcf过滤时GATK和bcftools的index报错及解决方式

gatk报错 An index is required but was not found for file drivingVariantFile。 bcftools报错 index: the file is not BGZF compressed, cannot index

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  • 星莓
  • 发布于 2023-12-05 10:01
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记录一个数据下载:GSE12417

geo_gene_exp_download.r

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-04 10:14
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库文件位置问题

      7 The following object is masked from ‘package:VennDiagram’:      8       9     ellipse     10      11 Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) :      12   unable to l...

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  • xun
  • 发布于 2023-11-30 17:00
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shell变量使用注意事项

shell变量使用的一些既定规则和方法

quota 显示的space 与du显示的不一致,导致文件上传失败

quota 显示的space 与du显示的不一致,导致文件上传失败

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-11-30 15:06
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叶绿体或线粒体基因组重复序列分类及鉴定

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  • 星莓
  • 发布于 2023-11-29 11:45
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叶绿体/线粒体基因组的串联重复序列鉴定——TRF

TRF网站是基因组注释中常用于检测序列中串联重复序列的软件,无需安装,使用简单方便,同样适用于细胞器基因组的串联重复序列鉴定。 https://tandem.bu.edu/trf/trf.html

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  • 星莓
  • 发布于 2023-11-29 10:51
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diff比较两个文件的内容

diff比较两个文件的内容

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  • 安生水
  • 发布于 2023-11-28 11:21
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泌尿感染(UTIs)宏基因组分析

泌尿感染(UTIs)宏基因组分析

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-11-26 21:25
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cytoscape安装报错:No JVM could be found on your system

cytoscape安装报错:No JVM could be found on your system,通常是由于不适配的java版本

circos|修改不同染色体之间区块block及连线link的颜色

circos圈图绘制时所有的修改参数都是基于配置文件config.txt。 想要让不同染色体之间区块显示不同颜色。可以修改config.txt中rule参数: <link> #全基因组共线性     bezier_radius=0r...

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  • rzx
  • 发布于 2023-11-22 11:41
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电脑连接了无线网却显示无internet连接的解决

我们电脑在无线网络连接的时候经常出现这样的情况: 方法一: 1. win + R 输入  service.msc,唤起任务管理器的服务界面   2. 找到这三个选项进行重启 方法二: 1. 右下角wifi选...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-11-22 10:13
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GeneDoc|绘制基因多序列比对图时对序列进行排序

打开GeneDoc软件,输入序列之后,序列顺序是输入文件中序列的顺序。如图: 这种情况下想使序列按照ID进行排序的话,应选择菜单栏中“Sequence List”选项,如图【S】: 在弹出界面选择<Sort...

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  • rzx
  • 发布于 2023-11-16 14:49
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ggtree绘图lable显示不全如何调整

解决ggtree绘图lable显示不全的问题

Linux中给文件中的某列添加千位分隔符

Linux中给文件中的某列添加千位分隔符

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  • 安生水
  • 发布于 2023-11-16 13:56
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BWA mem比对报错 paired reads have different names 解决

问题: 在用BWA进行序列比对时出现:[mem_sam_pe] paired reads have different names: "A00920:973:H5GWJDSX3:2:1103:2582:12633:UMI_AAT_GTA", "A00920:973:H5GWJDSX3:2:1103:1624:12633:UMI...

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  • 星莓
  • 发布于 2023-11-16 13:49
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R 包 osqp安装报错

R 包 osqp安装报错

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  • 发布于 2023-11-14 23:13
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命令行 光标移动技巧

一个熟悉linux的人,基本不太会为了移动光标而使用较远的方向键,更不会使用鼠标,那这是怎么做到的呢,我们来简单介绍一下 基础移动光标 Ctrl – a :移到行首Ctrl – e :移到行尾Ctrl – b...

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  • xun
  • 发布于 2023-11-14 18:04
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绘制venn图,2-7维

绘制venn图,2-7维

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  • 发布于 2023-11-13 13:59
  • 阅读 ( 753 )

arrow 安装失败可

arrow 安装失败可

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  • 发布于 2023-11-12 07:58
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