omicsgene
rmvnorm函数生成随机矩阵
借助rmvnorm()生成一个多维正态随机矩阵 安装mvtnorm包 > install.packages("mvtnorm")> library(mvtnorm) 生成随机矩阵x=rmvnorm(n,mean=rep(0,nrow(sigma)),sigma=diag(length(mean)…)...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-25 11:42
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Daitoue
利用NCBI当中的CD-search工具预测基因的保守结构域
搜索鉴定基因的保守结构域，应该用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search，而不是简单的用blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域，对研究基因的功能是非常重要的，因为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域！
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-23 12:11
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红橙子
安生水
Muscle 进行多序列比对
MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件，在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候，大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。
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- 安生水
- 发布于 2018-07-20 11:53
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blast比对结果说明
我们作比对时经常用到blast，其比对结果一般都用m8格式（即参数是 -m 8，blast+是 -outfmt 6），但是结果文件中是没有表头的，这里来写一下。
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- 安生水
- 发布于 2018-07-20 11:13
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microRNA
植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman
你可以对基因进行功能注释，分析其功能分类以及相关的通路信息，你也能分析基因的表达谱数据，但是你知道如何将二者进行结合吗？在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据？有一个工具可以做...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-20 09:18
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科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop
科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop，用好了这两个软件也会使你的文章配图增色不少，甚至事半功倍。
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-19 11:47
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eclipse当中R插件StatET安装
StatET是一个eclipse R语言高亮显示插件，可以高亮显示R语言代码。安装之前请在电脑中提前安装好R编译环境。 支持在Eclipse平台上（通过将代码发送到R）运行R代码 支持语法高亮显示 支持使用R代码模板 支持创建R的文档文件(*.Rd) 可以从Eclipse运行R命令
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-18 16:19
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生信老顽童
Rstudio 防止中文乱码（保存与显示）
为了防止代码文件出现中文乱码，一般在Rstudio中，都要求将文件保存为UTF-8格式，同时打开显示也要求以UTF-8格式进行显示，相应的设置方法如下： 保存文件： 进入Tools——Global Options，选...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-17 11:57
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删除向量中指定的元素（借助向量中元素索引）
在进行数据处理的过程中，可能会要求删除向量中某个指定的元素，这一操作可以利用R 语言向量中每个元素都对应一个索引完成，而获取索引下标可以利用which()，而match()只会返向量中第一次出现的...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-16 18:05
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关于Cytoscape利用蛋白质互作网络分析info文件绘制网络图过程中节点String_id转换成GeneID 或者Symbol问题
有学员反映在学习GEO芯片数据挖掘，进行利用差异基因进行蛋白质互作网络分析的过程中，获得的info文件中之涉及了String_id，利用Cytoscape进行绘图的过程中无法知道对应的具体基因ID是什么...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-16 10:26
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