R语言统计数据范围并用ggplot2绘制饼图

按范围统计数值分布,并用ggplot2绘制饼图;

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  • 发布于 2018-07-01 15:22
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百万样品GWAS解释精神疾病间的遗传关系

2018年,《Science》一篇研究论文通过对上百万例实验样品数据进行分析,揭示不同精神疾病之间享有共同的遗传变异,然而神经性疾病表现更为独立。

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  • omics007
  • 发布于 2018-06-29 22:13
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重磅!2018年最新期刊分区变动(1-4区)+2018影响因子汇总表-生命科学类免费下载

Excel表包含信息有:期刊全名、简写名、(2018及2017年)中科院分区、影响因子、学科分类、SCI/SCIE、投稿难易程度、审稿周期及期刊主页链接;并通过红、绿两种颜色来区分升级和降级期刊,期刊分区变化一目了然!进来下载!

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-06-29 22:09
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2018年最新SCI影响因子及中科院分区统计

2018年最新生命科学类SCI影响因子及中科院分区统计

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-06-29 21:51
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图片去除大块黑色区域

在使用MEGAN软件绘制分类学树状图时,如果物种较少,生成的图片会有大片的黑色区域,很不美观。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 14:55
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perl语言——正则表达式

正则表达式(regular expression)描述了一种字符串匹配的模式,可以用来检查一个串是否含有某种子串、将匹配的子串做替换或者从某个串中取出符合某个条件的子串等。 Perl语言的正则表达式功能非...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 14:32
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植物转录因子调控分析

介绍plantregmap网站的一些分析转录因子的功能

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-29 13:40
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R处理大数据时内存out of memory的问题

R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题,相关解决方法: 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况(MB) 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memo...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-29 13:16
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提取基因组所有基因的启动子序列

有时候们会需要基因的启动子序列,这里有脚本可以提取基因组所有基因的启动子序列。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 12:56
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什么是转录因子?

转录因子基本介绍

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-29 10:09
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你了解SAM和BAM文件吗

当我们测序得到的fastq文件map到基因组之后,会得到一个以SAM或Bam为扩展名的文件。这里将详细介绍SAM和Bam文件!

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 09:33
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统计不同样品-生物学重复基因表达量数据合并和绘图统计

处理统计RNA-seq 表达量数据,绘制柱状图,PCA散点图,还有不同样品表达基因维恩图。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-28 23:52
  • 阅读 ( 11977 )

微生物互作网络构建教程网站--Microbial association network construction tutorial

基于微生物16s测序数据中的OTU丰度矩阵可以进行微生物互作网络构建,从而探索微生物之间的互作关系。而网络的构建方法多种多样,下面给大家推荐一个网站,Microbial association network constr...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-28 22:18
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转录组分析时,影响差异基因数量的因素有哪些?

     差异基因的筛选是基于统计学意义的,不能直观的通过两个数值的大小判断差异基因的是否。 首先:受测序深度的影响,有些样品的测序深度较深,可能导致该样品的readcount数值较高,做差...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-28 16:33
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转录组差异基因为什么要进行聚类分析?

       聚类分析用于判断差异基因在不同实验条件下的表达模式,将表达模式相同或相近的基因聚集成类,进而识别未知基因的功能或已知基因的未知功能,这些同类基因可能具有相似的功能,共同参...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-28 16:28
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转录组测序样品间的相关性有何意义?如何计算?

样品间的相关性反应了样品间的相似程度,即不同处理或组织的样品在表达水平方面的相似度。相关系数越 接近1,样品间的相似度越高,样品间的差异基因也越少。生物学重复间的样品的相关系数...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-28 14:02
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大数据挖掘解决老年痴呆症百年难题

大数据挖掘解决老年痴呆症的病因,可能更病毒感染有关

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-28 10:12
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Cufflinks,Stringtie 合并转录本之后,如何筛选新转录本?

GTF文件中class code 注释转录本的类型

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-28 09:51
  • 阅读 ( 7155 )

R 删除重复数据

R 删除重复数据的方法,包括duplicated 和unique 针对duplicated, 对向量的元素或数据框的行进行操作的时候,返回逻辑值,以下面的数据框为例:  dat   A B C D1  a b a c2  c k b d3  c k c c4...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-27 22:00
  • 阅读 ( 4086 )

endnote 插入文献 变成临时 大括号{} 不自动更新文献

endnote 文献插入出现大括号,不自动更新解决办法

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-27 17:53
  • 阅读 ( 33830 )