perl处理文件路径

以前处理文件路径的时候都是自己写正则表达式，而用perl的模块来解决则更加迅速、准确。

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• 安生水
• 发布于 2018-06-14 15:51
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GSEA分析需要的文件及格式

在作芯片数据或者是转录组数据的GSEA分析时候，需要四个文件： 1、基因表达数据文件； 2、表型数据文件； 3、功能基因集文件； 4、芯片注释文件； 这四个文件只需要分析者提供前两个文件即...

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• landy
• 发布于 2018-06-14 15:11
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绘制基因结构图软件GSDS使用过程中图片的修改问题

在使用GSSE绘制基因结构或者是顺势作用元件时，如果图例太多，在网页展示不出来，这个时候你需要对图片进行修改.增大背景画布就可以显示了，点击下图红色箭头所指按钮，进入到图片编辑界面: 拉...

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• landy
• 发布于 2018-06-14 14:48
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生存分析的一些基本概念

生存分析的一些基本概念

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• microRNA
• 发布于 2018-06-14 10:58
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如何看懂微生物多样性分析当中三元相图ternary

三元相图查看说明

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• omicsgene
• 发布于 2018-06-13 13:07
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绘制生存曲线图

生存曲线图的绘制

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• microRNA
• 发布于 2018-06-08 18:17
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一个预测基因保守结构域网站

今天跟大家分享一个分析蛋白保守结构域的的网站： 网址：http://www.ebi.ac.uk/interpro/ 在上图的方框导入蛋白序列，点击submit，就开始运行，结果如下图所示： 这个网站不仅分析了蛋白的保...

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• landy
• 发布于 2018-06-08 18:06
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从GTF中提取lncRNA的编号和名称

从GTF文件中提取lncRNA对应的ID和名称

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• microRNA
• 发布于 2018-06-08 17:28
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bioperl处理fasta和fastq序列截取反向互补翻译等等

截取，反向互补，读入，写出，筛选等

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• omicsgene
• 发布于 2018-06-08 15:30
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分析基因家族时两种搜索基因家族成员方法比较

在分析基因家族时需要鉴定基因家族成员时，有两种鉴定方法: 第一种、利用蛋白保守结构域的隐马尔科夫模型搜索。 第二种、利用BLAST序列比对搜索基因家族成员。 这两种情况的适用条件：如果要...

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• landy
• 发布于 2018-06-08 14:48
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绘制类似于箱线图的散点图

使用R语言绘制类似于箱线图的散点图

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• 安生水
• 发布于 2018-06-08 12:06
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fastq文件查看指定序列

在处理fastq文件时，可能会遇到序列与质量值长度不一致或格式不正确等问题，这时候软件会报告哪条序列有问题，并给出序列ID，然后我们就要去查看这条序列是什么问题。但是，fastq文件通常是很大的，使用less命令可能很难搜索到

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• 安生水
• 发布于 2018-06-08 11:48
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关于基因家族课程中基因在染色体上位置提取不到问题分析

网易云基因家族课程中，在提取基因在染色体上的位置信息使用到的是一个脚本，大家经常的遇到一个问题就是没有提取出来信息。 下面是可能存在的问题之一： 脚本在处理信息时与gff文件的匹...

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• landy
• 发布于 2018-06-08 10:39
• 阅读 ( 5954 )

TCGA数据进行多因素生存分析

TCGA数据进行多因素的生成分析

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• microRNA
• 发布于 2018-06-08 10:09
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TCGA数据单因素cox生存分析

TCGA 表达数据进行单因素生存分析

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• microRNA
• 发布于 2018-06-08 10:02
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如何将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)或者Symbol

AnnotationDbi 和 结合物种对应的注释文件，将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)

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• Daitoue
• 发布于 2018-06-07 18:30
• 阅读 ( 35658 )

subset提取符合条件的数据

利用subset针对数据框按照条件进行判断和筛选数据

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• Daitoue
• 发布于 2018-06-06 21:06
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Split划分数据

在R中利用split，借助数据的分类类型，对数据进行分组

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• Daitoue
• 发布于 2018-06-06 20:40
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Bio-Linux中的生物信息学软件

Bio-Linux中有很多安装的生物信息学软件，这里给大家列举一下：

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• 安生水
• 发布于 2018-06-06 17:49
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R语言对基因表达量数据RNA-seq做PCA分析

PCA(principal component analysis )主成分分析，可以分析样品之间相关性，确定样品总体上的差异，或者查看是否有批次效应等

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• omicsgene
• 发布于 2018-06-04 15:21
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