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密度图--ggplot2

利用ggplot2绘制密度图，并直接在密度图上叠加另一组数据的密度曲线

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-25 13:01
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R批量读取文件

利用R 对文件夹下的文件批量读取

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-25 10:58
  • 阅读 ( 3735 )

WGCNA剔除异常样本

WGCNA剔除异常样本

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-25 10:53
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TCGA数据下载

TCGAbiolinks 下载 TCGA 数据

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-25 10:30
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awk基本参数解释

awk擅长于对文件按行操作，每次读取一行，然后进行相应的操作。 awk读取单个文件时的基本语法格式是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{print $0, $1;}' filename 读取多个文件时的语法是 awk...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-25 10:29
  • 阅读 ( 3411 )

WGCNA分析要求

WGCNA常见问题

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-25 10:04
  • 阅读 ( 11687 )

awk筛选差异基因

命令行筛选差异基因

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  • landy
  • 发布于 2018-05-24 18:03
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如何正确选择差异统计检验

对于科学问题，我们常常要找到差异，需要用到统计学检验，但是那么多统计学检验我该如何选择呢？

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-24 17:51
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perl对文件夹处理

用perl批量处理文件夹下所有文件 opendir（）获取目录权柄；readdir（）读取目录下文件 #!/usr/bin/perl -w $dirname = "/tmp";         #指定一个目录 opendir ( DIR, $dirname ) || die...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 16:15
  • 阅读 ( 3110 )

R语言计算平均值，中位数

Mean（）求平均值 通过求出数据集的和再除以求和数的总量得到平均值 函数mean()用于在R语言中计算平均值。语法 用于计算R中的平均值的基本语法是 - mean(x, trim = 0, na.rm = FALSE, ...)...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 15:53
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beta多样性中的距离矩阵总结

距离矩阵差别：jaccard bray-curtis 欧式距离 unifrac（weighted/unweigted）

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-24 13:20
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linux下替换文件中的换行符

之前在linux系统执行以下命令： ls file |xargs sed -i 's/\n//g' 然而却发现没有任何效果，百度之后发现 sed是按行处理文本数据的，每次处理一行数据后，都会在行尾自动添加trailing newline...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 10:35
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什么是GSEA?

GSEA的定义 Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分析)用来评估一个预先定义的基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势，从而判断其对表型的影响作用。其输入数据包含两部分...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-24 10:20
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Ka/Ks与进化选择压力

Ka/Ks表示的是非同义替换（Ka）和同义替换（Ks）之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。 同义/非同义突变概念  同义突变表示氨基酸没有改变，氨基酸没...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-23 16:53
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组学大讲堂视频课程

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-22 13:04
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pubmed按影响因子分类文献

pubmed按影响因子归类搜索文献

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-20 10:06
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分子生物学纪要：（1）

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linux:简单使用（2）

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