借助perl脚本进行文件整理 | 将按第一列信息整理的文件改成按照第二列信息整理

perl data.pl id1.txt id2.txt 现有一文件,有两列,是按照第一列内容进行展示的,如下图:A    green;red;blueB    yellow;greenC    red;blue;grey;pink;blankD    green;grey现在想将文件...

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  • rzx
  • 发布于 2023-12-28 15:32
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利用 NAS 对实验室数据进行存储备份

利用 NAS 对实验室数据进行存储备份

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-28 14:21
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make Cladogram with microbiomemarker

给大家介绍一个R包用于绘制Cladogram,直接附上代码: if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) { install.packages("BiocManager")}​BiocManager::install("microbiomeMark...

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  • xun
  • 发布于 2023-12-28 11:11
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Rocky 9.1修改IP地址

Rocky 9.1修改IP地址

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  • 安生水
  • 发布于 2023-12-28 09:43
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BLINK(C版本) 进行 GWAS分析的教程

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  • 星莓
  • 发布于 2023-12-27 11:31
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bam文件排序

通常进行SNP calling的之前我们需要对比对的bam文件进行排序、去重等工作,在这里介绍几种sort bam的方法。 1. 按照比对位置进行排序 sambamba比samtools快很多,samtools和sambamba默认按...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-12-27 11:05
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SURVIVOR工具进行结构变异结果文件的格式转换(bedtovcf)

结构变异结果文件格式转换工具——SURVIVOR

R语言中转换成dummy dummy-variables 虚拟变量

转换成dummy dummy-variables

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-21 15:11
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R中的错误处理函数

很多时候简单的try函数就能够增加脚本的鲁棒性,随着脚本逐渐复杂,一些较高级的错误处理函数就必不可少了,我们今天来介绍几个R中的 1. tryCatch() 函数 功能: tryCatch() 函数是一种更复杂...

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  • xun
  • 发布于 2023-12-19 14:39
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微生物与环境因子,代谢物,功能等相关性分析linkET

微生物与环境因子,代谢物,功能等相关性分析linkET

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-19 08:20
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叶绿体或线粒体重复序列圈图绘制

叶绿体或线粒体重复序列圈图绘制

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  • 星莓
  • 发布于 2023-12-18 17:12
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awk同时读取两个文件

awk使用NR==FNR同时读取两个文件

ssh登陆报错

ssh登陆报错

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  • 安生水
  • 发布于 2023-12-18 16:19
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下载AI字体

最近在使用AI软件对iTol生成的pdf文件进行修改。当AI导入文件后弹出提示窗口如下: “缺少字体。将使用替换字体显示受影响的文本。” 一般情况下可以忽略提示。 但这次的文件在忽略提示直接导...

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  • rzx
  • 发布于 2023-12-18 15:40
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NCBI 数据下载

介绍如何在大型生物数据库NCBI上下载数据

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-12-18 11:25
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GATK|Timeout of 30000 milliseconds was reached while trying to acquire a lock on file raw.vcf.tmp.idx.

解决办法:https://www.omicsclass.com/article/2194 这里还有一个需要做的步骤,就是先将raw.vcf.tmp.idx文件找到并删除,一般情况下这个文件是空的。 然后再在命令行中添加-disable_auto_in...

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  • rzx
  • 发布于 2023-12-15 10:23
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细胞焦亡、铁死亡及铜死亡等基因集

细胞焦亡、铁死亡及铜死亡浅析

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-14 14:37
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在这个科研内卷的年代,你没有好设备,没有好材料,没有充足经费,怎么立足?毕业、就业、发文、评职称,靠什么来实现?留给你破局的选择不多!!为此,我们组学大讲堂决定干一票大的!我们将永...

SURVIVOR合并单样品SV出错

在做SV、CNV变异检测时,会使用SURVIVOR将不用样品的vcf文件合并到一起,命令如下: ls *.max.vcf >sample_files && /share/work/biosoft/SURVIVOR/SURVIVOR/Debug/SURVIVOR merge...

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  • 安生水
  • 发布于 2023-12-13 13:51
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一行代码检查GWAS分析中表型数据的错误

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  • 星莓
  • 发布于 2023-12-13 10:56
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