在生信分析时,经常会做一下蛋白多序列比对。对于比对结果中,一些不保守的列,我们可以选择剪切掉。再进行之后的分析,比如构建进化树,进化树的构建会容易很多。 剪切序列时有一个非常好用的...
InterProScan是InterPro数据库提供给用户的一个软件包,通过集成数据库鉴定蛋白质功能、所属的家族及其包含的结构域和位点
RNA-seq分析进行SNP calling之前会对bam文件进行一系列处理,包括排序、去重、将落在外显子上的reads分离出来,取出N错误碱基,在去重(MarkDup)过程中出现报错: 是由于fq文件中出现了两次...
Path::Tiny 是一个专注于简洁性和便利性的 Perl 模块,用于处理文件和目录操作。以下是 Path::Tiny 的一些主要功能 1,目录相关 在perl 里很多人会使用 mkdir path unless(-d path); 来创建...
docker配置国内源加速下载,linux版本
break报错
微生物多样性扩增子(16S/18S/ITS)课程更新v2.0
在使用python的时候经常需要调用库及module,有的时候分明已经import了,在运行的时候却收到 ModuleNotFoundError的报错。那么Python到底是从哪里、以什么样的顺序调用的呢? 在Python中有内建...
gatk报错 An index is required but was not found for file drivingVariantFile。 bcftools报错 index: the file is not BGZF compressed, cannot index
geo_gene_exp_download.r
7 The following object is masked from ‘package:VennDiagram’: 8 9 ellipse 10 11 Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 12 unable to l...
shell变量使用的一些既定规则和方法
quota 显示的space 与du显示的不一致,导致文件上传失败
TRF网站是基因组注释中常用于检测序列中串联重复序列的软件,无需安装,使用简单方便,同样适用于细胞器基因组的串联重复序列鉴定。 https://tandem.bu.edu/trf/trf.html
diff比较两个文件的内容
泌尿感染(UTIs)宏基因组分析
cytoscape安装报错:No JVM could be found on your system,通常是由于不适配的java版本
circos圈图绘制时所有的修改参数都是基于配置文件config.txt。 想要让不同染色体之间区块显示不同颜色。可以修改config.txt中rule参数: <link> #全基因组共线性 bezier_radius=0r...
我们电脑在无线网络连接的时候经常出现这样的情况: 方法一: 1. win + R 输入 service.msc,唤起任务管理器的服务界面 2. 找到这三个选项进行重启 方法二: 1. 右下角wifi选...