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零假设与备择假设

零假设（null hypothesis），统计学术语，又称原假设，指进行统计检验时预先建立的假设，这个假设一般是未进行实验之前最保守和有意推翻的假设，而之后实验的目的一般是希望证明其假设错误。零...

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rzx
发布于 2022-12-09 15:23
阅读 ( 3588 )

NCBI下载SRR并转换为fastq文件

想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据，看了一些下载教程，方法各异，看完思路还是不清晰，以下记录我的操作步骤，仅供参考

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星莓
发布于 2022-12-09 11:56
阅读 ( 8315 )

repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件，可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽

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omicsgene
发布于 2022-12-07 10:13
阅读 ( 1974 )

pip报错

出现报错WARNING: Running pip as the 'root' user can result in broken permissions and conflicting behaviour with the system package manager. It is recommended to use a virtual envir...

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xun
发布于 2022-12-05 16:42
阅读 ( 2714 )

NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta，gff3，gtf，gb文件等

NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta，gff3，gtf，gb文件，以及获得细胞器基因组的全部基因名称

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星莓
发布于 2022-12-05 14:58
阅读 ( 7659 )

mysql启动时报错：error while loading shared libraries: libncurses.so.5: cannot open shared object file

mysql启动时报错

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安生水
发布于 2022-12-05 14:14
阅读 ( 1647 )

MySQL报错：ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock'

MySQL报错：ERROR 2002 (HY000)

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安生水
发布于 2022-12-05 14:09
阅读 ( 1916 )

添加千位分隔符

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安生水
发布于 2022-12-05 14:02
阅读 ( 1131 )

interpro 查询结构域

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生信阿姨
发布于 2022-12-01 13:14
阅读 ( 3552 )

超大基因组，超长染色体，凤丹牡丹基因组怎一个难字了得！

上海辰山植物园联合中科院植物研究所、中科院分子植物卓越中心在NC发文公布凤丹牡丹基因组及其关键性状的分子基础！

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omics007
发布于 2022-11-30 15:10
阅读 ( 2243 )

真菌 ncRNA 基因特征及坚定方法

Haas BJ, Zeng Q, Pearson MD, Cuomo CA, Wortman JR. Approaches to Fungal Genome Annotation. Mycology. 2011 Oct 3;2(3):118-141. doi: 10.1080/21501203.2011.606851. PMID: 22059117; PMCID: PMC3207268.

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omicsgene
发布于 2022-11-30 14:07
阅读 ( 685 )

uniref50 数据库下载及格式化

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omicsgene
发布于 2022-11-29 10:42
阅读 ( 1917 )

singularity运行fastqc报错OutOfMemoryError

比如在singularity中运行： singularity exec /share/singularity_images/reseq_v1.2.sif fastqc $datadir/*.gz -o $workdir/1.fastqc 可能报错：可以加一个-t选项，多线程运行，如下图，...

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生信老顽童
发布于 2022-11-25 13:16
阅读 ( 1094 )

blastp 快速比对注释基因，输出注释信息

blastp -query unknown.pep.fa -db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta -num_threads 10 -evalue 0.000001 -seg yes -soft_masking true -lcase_masking -max_hsps 1...