安生水
add a Convex Hull with module
有的文章会在模块化的群落里加上Convex Hull ,类似这样,如何实现呢,可以借助ggforce的geom_mark_hul 比如我们的示例代码稍作修改 library(ggforce) 主要是加了最后一行,的geom_mark_hull...
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- xun
- 发布于 2024-07-11 09:20
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xun
给进化树标定化石时间
进化树（Phylogenetic Tree）是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中，每个分支点（节点）代表一个共同祖先，而每个末端的分支（叶节点）代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间，即在进化树上标注时间点，为进化树提供了一个时间框架，便于超度量树的构建
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- Ti Amo
- 发布于 2024-07-10 17:43
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Ti Amo
omicsgene
对水稻做GO和KEGG富集分析，如何获取水稻的数据库？
我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候，需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-07-05 14:39
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每天学习一点点
无法访问zenodo
多个浏览器均无法访问zenodo网站 解决方法： 1. 找到ip：188.185.79.172 查询ip的网址：站长工具 - 站长之家 (chinaz.com) 2. 进入C:\WINDOWS\system32\drivers\etc，修改host权限 3、...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-07-02 15:58
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空间转录组数据预处理
空间转录组简介 空间转录组，顾名思义，是在转录组的基础上加上了空间位置信息。如果不借助空间的技术,我们的转录组一般是粉碎组织到细胞层级或者更低的rna碎片层级,而进行sc RNA或者Bulk...
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- xun
- 发布于 2024-07-02 15:56
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eQTplot包绘图报错解决：“Caused by error in `db_collect()`”
解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-06-30 09:52
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-CRC直肠癌(GSE178341)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-CRC直肠癌(GSE178341)
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- omicsgene
- 发布于 2024-06-27 14:03
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(GSE161529)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(GSE161529)
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- omicsgene
- 发布于 2024-06-27 13:48
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107)
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- omicsgene
- 发布于 2024-06-27 13:33
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BLCA膀胱癌(GSE192575)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-BLCA膀胱癌(GSE192575)
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- omicsgene
- 发布于 2024-06-27 11:44
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qsub任务投递系统的常用命令 SGE任务调度
qsub全称为”Queue Submitter”，是Sun Grid Engine (SGE)集群管理软件中的一个命令行工具。它的主要作用是将用户提交的任务加入到队列中，等待计算节点执行。qsub可在Unix/Linux等操作系统下使用...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-06-26 17:54
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eQTpLot包的安装
eQTpLot 是一个直观且用户友好的 R 包，专为可视化 eQTL 和 GWAS 结果的共定位而开发。eQTpLot 将标准 GWAS 和 eQTL 统计结果以及可选的成对 LD 信息作为输入，以生成一系列图表，可视化给定基因-性状对的 eQTL 和 GWAS 信号之间的共定位、相关性和富集。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-06-26 16:06
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蛋白质组学数据定量搜库 | MaxQuant软件的使用
简介： MaxQuant是基于质谱(Ms)的蛋白质组学数据分析最常用的平台之一，免费使用，目前认可度相对较高，可针对多种质谱数据格式（.raw、.wiff、.mzML、.mzxml）。且内置了自己的肽段搜索引擎-...
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- rzx
- 发布于 2024-06-26 11:52
- 阅读 ( 2160 )
rzx
