singularity 利用docker 镜像压缩包构建 sif文件
singularity 利用docker 镜像压缩包构建 sif文件
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-05 20:22
- 阅读 ( 3090 )
omicsgene
runc 与 containerd.io 冲突安装不上runc
/etc/yum.repos.d/docker-ce.repo
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-05 20:14
- 阅读 ( 3028 )
安生水
跟着文献学做图 | 用蛋白质序列做主成分分析（PCA）
提到主成分分析，一般我们都是使用Plink，GCTA等软件基于SNP数据来操作，那么如果我们用蛋白质序列，能不能做主成分分析，如何做呢？ 答案是可以做，让我们一起来学习怎样做出与文献一样的图吧~
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- 星莓
- 发布于 2022-11-03 16:49
- 阅读 ( 4185 )
星莓
生信阿姨
使用DNA序列做主成分分析（PCA）——R语言adegenet包
提到主成分分析，一般我们都是使用Plink，GCTA等软件基于SNP数据来操作，那么如何用DNA序列做主成分分析呢？ 思路是先比对，之后使用R语言的adegenet包把比对的数据转换成snp数据，用到的函数是fasta2genlight()，再进行PCA分析及绘图。
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- 星莓
- 发布于 2022-10-31 11:33
- 阅读 ( 4910 )
python操作大文件删除某行
删掉文件其中一行，非常简单，不过如果一个文件很大以至于无法读到内存里，又该怎么操作呢 其实我们可以使用 open() 方法把需要修改的文件打开为两个文件，然后逐行读入内存，找到需要删除的行...
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- xun
- 发布于 2022-10-24 16:10
- 阅读 ( 1532 )
xun
Perl方法对文档全文进行字符串对应替换
举个例子：从数据库中下载基因组数据，基因组.gff文件中染色体ID较为复杂（第一列） 从全基因组序列.genome.fa文件中找到染色体ID对应简写 想将gff文档中染色体ID全部替换成第二列LC*命名...
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- rzx
- 发布于 2022-10-24 14:38
- 阅读 ( 1438 )
rzx
sort 按照染色体排序后按位置坐标排序
经常会遇到对bed文件或其他相关数据的排序，记录一下如何先按照染色体号排序，然后按照坐标位置排序。 sort -k1,1 -k2n file1 > file2 排序完成后如下：
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- 星莓
- 发布于 2022-10-24 09:55
- 阅读 ( 2050 )
r绘图0不在原点的问题
使用plot画图的时候，只是设定xy轴范围仍然在0之前会有一小段多出来的范围 例如：plot(runif(10,0,10),type="l",xlim=c(0,10),ylim=c(0,10)) 使用：xaxs/yaxs="i" 代码即可解决 例如：plot(r...
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- xun
- 发布于 2022-10-21 17:29
- 阅读 ( 2162 )
GeMoMa-1.9.jar 报错mbol: g_settings_backend_get_type
mbol: g_settings_backend_get_type
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- omicsgene
- 发布于 2022-10-19 15:19
- 阅读 ( 1285 )
notepad++显示所有字符（隐藏的回车换行空格）转换CRLF
notepad++显示所有字符（隐藏的回车换行空格）转换CRLF
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- 生信阿姨
- 发布于 2022-10-19 09:42
- 阅读 ( 4582 )
