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如何预测CpG岛

在人类基因组的广袤海洋中，隐藏着许多生物学上重要的结构，其中之一就是CpG岛。这些富含CpG二核苷酸的DNA序列区域在基因表达调控中扮演着关键角色。然而，要想有效地理解这些岛屿的功能，首先...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-06-04 14:44
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QTL定位方法介绍

QTL定位方法介绍

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-06-03 09:44
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VScode文档列对齐插件-code alignment

一款VScode中文档列对齐的插件

快速整理shell里面用到的脚本；

shell

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-05-24 10:27
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sed使用

在Linux系统中，sed（stream editor）命令是一个非常强大的文本处理工具。它主要用于对文本文件进行过滤和转换操作，支持非交互式的文本编辑。今天，我们就来深入了解一下sed命令的详细使用方法...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-05-20 15:38
  • 阅读 ( 607 )

基于 gff 文件构建 TxDb 包

TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的，用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb （transcript database）包，有两种构建方式，一...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-15 16:45
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基于 gff 文件构建 TxDb 包

TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的，用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb （transcript database）包，有两种构建方式，一...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-15 16:41
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探索基因大数据的利器——SRA Explorer

探索基因大数据的利器——SRA Explorer

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-08 15:19
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惊喜价！转录组299元/个

cytoscape软件的安装与使用_v3.10.2

Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络，并依据基本的数据的结合成可视化网络。

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  • rzx
  • 发布于 2024-04-30 17:41
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在运行R时报错缺失libpcre2-8.so.0这个共享库文件

libpcre2-8.so.0是PCRE（Perl Compatible Regular Expressions）库的一个版本，通常用于支持正则表达式。

htop查看程序的io占用

传统的top大家都用的很多,但是top里不会显示磁盘io,而在我们服务器里,磁盘高io往往才是程序运行的瓶颈 新版 的htop新增了io 的查看,读写过高对应选项会变成红色,方便我们查看,除此之外htop还有...

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  • xun
  • 发布于 2024-04-25 11:03
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NCBI 基因组文件下载——datasets

datasets和dataformat是NCBI的命令行（Command line tools）工具，datasets可以下载ncbi上的生物数据，dataformat可以将metadata数据从json格式转化成其他格式类型。 1. 下载工具 curl -o d...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-04-24 16:52
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运行useradd -m us001 时报错：Creating mailbox file: File exists

运行useradd -m us001 时报错：Creating mailbox file: File exists

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  • 安生水
  • 发布于 2024-04-22 14:37
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遗传图谱构建基础知识

遗传图谱构建基础知识

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-04-22 13:27
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linux复制软连接的源文件

直接使用cp拷贝一个软连接,就只能得到一个软连接 但如果有的时候我们需要将软连接指向的文件复制到本地,就可以用到-L参数 其中-L是复制源文件,-l则是创建一个硬链接,注意别用错了

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  • xun
  • 发布于 2024-04-22 13:20
  • 阅读 ( 978 )

遗传图构建-SNP标记分型

遗传图构建-SNP标记分型

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-04-17 09:07
  • 阅读 ( 1128 )

R 安装包：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.

R 安装包：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-04-16 15:38
  • 阅读 ( 914 )

IF=8.7 | T2T康乃馨基因组揭示了相同基因在不同单倍型基因组中的表达差异

2024年1月 Horticulture Research杂志在线发表了一篇题为“The haplotype-resolved telomere-to-telomere carnation (Dianthus caryophyllus) genome reveals the correlation between genome ar...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-04-15 13:34
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SNP 过滤标准保证数据质量及参考文献：

最近有审稿人问我们的SNP过滤标准的合理解释，这里总结一下相关的参考文献和标准的出处

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-04-12 16:59
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