扩增子序列直接物种注释代码

扩增子单条序列注释 汇总代码如下 import rewith...

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  • xun
  • 发布于 2024-01-22 11:23
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rMATS turbo使用

rMATS turbo使用

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  • 安生水
  • 发布于 2024-01-17 11:30
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R语言使用ggraph绘图导出pdf报错——“invalid font type”

使用ggraph绘图,在结果导出pdf的时候报错,不可用的字体类型“invalid font type” 如果继续使用ggsave导出,可以直接载入字体: library(showtext) font_add('Times','/Library/Fonts/T...

seqcluster软件安装

seqcluster软件安装

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  • 安生水
  • 发布于 2024-01-10 13:38
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超快的文件传输软件trzsz

对于服务器而言,和本地的文件互相传输是家常便饭,scp虽然快速,但是毕竟要打很多字,有点麻烦,lrzsz十多年没跟新了,所以我推荐了这个软件trzsz用法和lrzsz差不多,也有额外的功能,有需要自己看帮助...

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  • xun
  • 发布于 2024-01-09 10:56
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Rna-seq 去除批次效应ComBat-seq

ComBat-seq

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-01-09 10:54
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ftp链接登陆下载文件

我们进行文件下载的时候通常可以直接通过网页的download或者是服务器的wget命令,但是是一个需要登陆的ftp地址,这两个方法就不太适用了,本文提供给大家一些ftp地址的登陆方法。 1. 个人电...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-08 10:41
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sort -V | 对字符和数值组合的排序

sort命令有很多选项参数,其中-n选项可以对文件内容进行数字排序。但是当想排序的列是由字符和数字组成的时候,这个选项就不能达到想要的效果。 1.例如,对某个文件列进行排序: #cat 1.txt11...

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  • rzx
  • 发布于 2024-01-05 13:28
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LTR_HARVEST的并行软件LTR_HARVEST_parallel

在对基因组进行评估的时候,LAI是连贯性完整性的指标之一。目前经常使用的计算 LAI 的软件是 LTR_retriever,他并非是一个单一的工具,而是通过整合多个LTR预测软件的结果,过滤其中的假阳性LTR...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-04 14:29
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使用compare_means()t.test进行显著性检验时报错

compare_means()函数进行t.test时报错——“not enough 'x' observation”

BaiduPCS-Go上传经常出错

使用BaiduPCS-Go上传文件经常出现错误,检查一下版本 直接使用软件自带的不一定下载成功 ,所以手动下载一下,这个版本直接解压就行,有需要的可以下一下,不需要编译了, BaiduPCS-Go-v3.9.5-li...

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  • xun
  • 发布于 2024-01-02 15:54
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借助perl脚本进行文件整理 | 将按第一列信息整理的文件改成按照第二列信息整理

perl data.pl id1.txt id2.txt 现有一文件,有两列,是按照第一列内容进行展示的,如下图:A    green;red;blueB    yellow;greenC    red;blue;grey;pink;blankD    green;grey现在想将文件...

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  • rzx
  • 发布于 2023-12-28 15:32
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利用 NAS 对实验室数据进行存储备份

利用 NAS 对实验室数据进行存储备份

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-28 14:21
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make Cladogram with microbiomemarker

给大家介绍一个R包用于绘制Cladogram,直接附上代码: if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) { install.packages("BiocManager")}​BiocManager::install("microbiomeMark...

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  • xun
  • 发布于 2023-12-28 11:11
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Rocky 9.1修改IP地址

Rocky 9.1修改IP地址

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  • 安生水
  • 发布于 2023-12-28 09:43
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BLINK(C版本) 进行 GWAS分析的教程

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  • 星莓
  • 发布于 2023-12-27 11:31
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bam文件排序

通常进行SNP calling的之前我们需要对比对的bam文件进行排序、去重等工作,在这里介绍几种sort bam的方法。 1. 按照比对位置进行排序 sambamba比samtools快很多,samtools和sambamba默认按...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2023-12-27 11:05
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SURVIVOR工具进行结构变异结果文件的格式转换(bedtovcf)

结构变异结果文件格式转换工具——SURVIVOR

R语言中转换成dummy dummy-variables 虚拟变量

转换成dummy dummy-variables

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-21 15:11
  • 阅读 ( 1004 )