全部 - 文章 - 第8页 - 组学大讲堂问答社区

sort: write failed: /tmp/sort0JADkd: No space left on device报错

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安生水
发布于 2024-04-12 10:29
阅读 ( 1078 )

利用vcftools分析玉米和大刍草基因组区域或基因区域是否受到选择

通过已经发表的玉米和大刍草基因组变异数据来计算感兴趣的基因组位置上，是否受到选择。主要是比较大刍草和玉米之间，该区间的多样性是否会下降，如果该区域内SNP的多态性下降，表明该区域内受到了选择。

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每天进步一点点
发布于 2024-04-04 10:59
阅读 ( 748 )

tassel PCA报错

tassel 跑PCA的时候由于SNP位点太多报错

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每天学习一点点
发布于 2024-04-01 18:19
阅读 ( 942 )

转录组个性化分析之可变剪切分析工具：rMATS turbo

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安生水
发布于 2024-04-01 11:36
阅读 ( 3619 )

svg2xxx运行报错

/share/work/biosoft/tools/distributing_svg_4.74/svg2xxx_release/svg2xxx all.KEGG.svg ./ -dpi 300 Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedOperationException: The Security Ma...

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xun
发布于 2024-03-26 11:31
阅读 ( 735 )

一些常见R代码的报错和解决办法

Error: cannot allocate vector of size X Gb 这种问题尤其在32位R版本中常见，因为它们对可用内存有限制。即使在64位版本中，当数据集非常大时也可能遇到内存问题。解决这个问题通常需要优化...

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xun
发布于 2024-03-25 14:39
阅读 ( 1209 )

GATK 4.4.0报错“ A JNI error has occurred, please check your installation and try again”

报错在利用GATK进行markdup和variant calling的时候出现报错：报错的主要信息用红框框出了，错误信息是：错误为发生JNI错误，请检查安装并重试。出现报错的原因： 1. javac与java版本...

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Ti Amo
发布于 2024-03-25 11:54
阅读 ( 946 )

R语言-文件行名重复，对行名重命名

R语言对重复的行名进行重命名操作

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每天学习一点点
发布于 2024-03-25 10:29
阅读 ( 1163 )

windows安装Aspera Connect软件

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安生水
发布于 2024-03-22 17:29
阅读 ( 1986 )

illumina平台转录组299/样品，组学大讲堂学员专属福利！速来报名吧！

转录组测序冰点价格，百万让利！

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生信老顽童
发布于 2024-03-19 17:54
阅读 ( 1360 )

在Windows系统中安装并使用seqkit工具

seqkit软件介绍： Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件，由go语言编写，功能比较完善，软件使用也很稳定。下载链接：https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式： 1. 点...

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rzx
发布于 2024-03-19 17:01
阅读 ( 1790 )

bcftools创建vcf索引失败

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安生水
发布于 2024-03-18 13:44
阅读 ( 749 )

遗传图谱中各种作图群体介绍

基因定位在动植物研究中非常重要，利用遗传图谱很多科学家定位了重要作物的重要农艺性状，例如克隆水稻分蘖基因 MOC1 的李家洋院士团队，克隆了水稻粒重基因 GW2 的林鸿宣院士团队……，还有数以...

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omicsgene
发布于 2024-03-14 18:05
阅读 ( 3103 )

GFF或GTF格式转bed

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安生水
发布于 2024-03-14 14:02
阅读 ( 1032 )

不同物种基因组之间的比对与可视化

基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较，以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...

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Ti Amo
发布于 2024-03-13 15:15
阅读 ( 3681 )

不同物种基因组之间的比对与可视化

基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较，以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...

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Ti Amo
发布于 2024-03-13 15:14
阅读 ( 1304 )

Linux重定向以及nohup不输出的方法

在Linux中，0、1和2分别代表标准输入（stdin）、标准输出（stdout）和标准错误输出（stderr）

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每天学习一点点
发布于 2024-03-13 11:49
阅读 ( 903 )

使用bcftools文件提取vcf文件子集

1. 准备好要提取的染色体及位置信息文件id.list。文件示例如下： Chr1 11787600 11793521Chr1 30028805 30042382Chr1 54966087 54970283Chr1 57228272 ...

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rzx
发布于 2024-03-11 18:13
阅读 ( 3533 )

qiime自带的alpha_diversity.py脚本报错

alpha_diversity.py -i some.biom -m observed_species,shannon,chao1,simpson,ace,goods_coverage 在运行时报错 File "/share/work/biosoft/python/Python-v2.7.11/lib/python2.7/site-p...

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xun
发布于 2024-03-11 09:43
阅读 ( 782 )

TukeyHSD报错

Error in TukeyHSD.aov(., ...) : no factors in the fitted model Calls: %>% ... is.data.frame -> <Anonymous> -> TukeyHSD -> TukeyHSD.aov In addition: Warning mess...