全部 - 文章 - 第83页 - 组学大讲堂问答社区

双通道芯片MA和density

limma包可以对芯片数据进行处理绘图

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Daitoue
发布于 2018-12-14 16:50
阅读 ( 4944 )

Evolview：进化树设置标签的颜色

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安生水
发布于 2018-12-14 16:28
阅读 ( 7686 )

Evolview：进化树设置标签的背景颜色

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安生水
发布于 2018-12-14 16:17
阅读 ( 7630 )

avereps相同ID取均值（limma包函数）

avereps按照ID取均值

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Daitoue
发布于 2018-12-14 15:35
阅读 ( 18757 )

轻松搞定iTOL注释文件

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安生水
发布于 2018-12-14 15:21
阅读 ( 16912 )

一条命令筛选基因组指定区域内的所有基因

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安生水
发布于 2018-12-14 15:15
阅读 ( 5453 )

一文教你转录组数据如何挖、文章怎么写！

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microRNA
发布于 2018-12-14 15:09
阅读 ( 19274 )

进化树中bootstrap值设置

Evolview这款在线软件在进化树修饰方面非常出色。在设置Bootstrap值的显示方式上也是非常的优秀。设置方法 1.使用进化树“(A:0.1,(B:0.2,(C:0.3,(D:0.4,E:0.5)40:0.6)80:0.05)100:0.1)90:...

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安生水
发布于 2018-12-14 14:43
阅读 ( 16103 )

基因结构图添加domain信息

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安生水
发布于 2018-12-14 14:24
阅读 ( 6743 )

进化树中如何添加分组圆环

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安生水
发布于 2018-12-14 13:55
阅读 ( 11829 )

蛋白质组和转录组相关性图绘制

蛋白质组合转录组相关性图绘制

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microRNA
发布于 2018-12-14 11:50
阅读 ( 5371 )

awk匹配替换gsub

awk中gsub可以进行匹配替换： gsub(A,B)在$0中利用B替换A gsub(A,B,C)在指定的C中用B替换A 以数据test为例（TAB分隔）： ABCD abcd HJIKEL AbDE SGWA 全部替换 A字符换成DA字...

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Daitoue
发布于 2018-12-14 10:28
阅读 ( 7766 )

GFF中提取所有转录本的位置信息，以及对应的基因ID信息；

提取基因的转录本信息，以及对应的基因ID；

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omicsgene
发布于 2018-12-13 22:33
阅读 ( 9355 )

perl输出基因的位置信息按照基因所在染色体，和位置信息排序

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omicsgene
发布于 2018-12-13 22:26
阅读 ( 5947 )

TCGA癌症和正常组织中的基因表达差异图

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microRNA
发布于 2018-12-09 22:38
阅读 ( 14314 )

ROC曲线的含义

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microRNA
发布于 2018-12-09 21:28
阅读 ( 4877 )

机器学习预测的混淆矩阵

机器学习混淆矩阵

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microRNA
发布于 2018-12-09 21:12
阅读 ( 3862 )

转录组中Count, TPM,FPKM如何计算

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microRNA
发布于 2018-12-09 10:49
阅读 ( 28921 )

Illumina microarray未标准化数据分布

不同于affy包对affymetrix芯片数据分布绘图，Illumina microarray数据分布是基于lumi包： boxplot-method density-method affy包也可以利用boxplot，不过密度图确实利用hist,此处就展示一...

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Daitoue
发布于 2018-12-07 17:23
阅读 ( 3922 )

芯片RNA降解情况

芯片RNA降解图 RNA的降解是影响芯片数据质量的一个很重要因素，一般，RNA从5端开始降解，所以理论上探针5端的荧光强度应该低于3端。 RNA降解曲线的斜率表示了这种变化趋势，斜率越小，说明降...

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Daitoue
发布于 2018-12-07 16:38
阅读 ( 5008 )