Biomarker有助于疾病诊断、判断疾病分期或者用来评价新药或新疗法在目标人群中的安全性及有效性。基于WGCNA,对疾病相关的基因表达数据构建网络,鉴定关键模块和hub基因,是筛选Biomarker的有效...
iTOL对进化树添加外部标签
iTOL进化树外层添加圆环
获取芯片原始数据得到为标准化的数据,需要查看原数据的分布情况,可以通过多种方法获得分布图片。 以affy包ReadyAffy()读取CEL结果:AffyBatch对象为例(GSE66196) 1、箱线图:基于boxplo...
linux系统使用,适合初学者
基因芯片灰度图是最原始的图像,每个灰度值都反映了图像所对应芯片位置的荧光分子相对强度信息。
采用biopython 计算蛋白质的等电点
芯片原始数据下载后进行质控标准化除了基于相关的软件外,也可以利用bioconductor的几个包,不过需要注意介于R版本的问题,包的安装基于install.packages可能安装不成功。
iTOL如何修改标签
计算lncRNA 与基因的表达相关性
python 批量发送邮件
阿里云短信发送API笔记
分组柱状图的绘制可以基于ggplot2,具体可以参考: 分组柱状图--ggplot2 。 如何针对分组柱状图添加误差线并合理调整位置呢?主要基于geom_errorbar及其参数position进行细节调整。 譬如基于上...
从基因组注释信息GFF文件中提取所有基因位置信息-AWK
grep 统计fasta文件当中有多少条序列
linux命令之grep
基因家族分析 后续实验
vbox com 失败
biolinux安装包下载链接:https://pan.baidu.com/s/1ui9ndOsjbtgHrJoxxOcTMQ