omicsgene
proteusTMT 分析蛋白质组数据时，meta文件的格式是怎么样的？
proteusTMT 分析蛋白质组数据时，meta文件的格式设置非常重要
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- microRNA
- 发布于 2018-11-23 16:14
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microRNA
生信老顽童
R语言sort()与order()
基于sort()或者order对向量元素排序：返回排序后的向量，后者返回原排序后的索引 例如基于向量A操作（A也可以是数值型)： > A=c("A","B","D","C","H","J","E") 1、sort sort(x, decrea...
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- Daitoue
- 发布于 2018-11-23 15:43
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Daitoue
R语言scale()标准化
R语言中scale函数，可以对数据进行处理，标准化（归一化）在一定的范围，比较适合大范围变化数据归一化处理从而观察数据变化趋势 scale()函数 scale(x, center = TRUE, scale = TRUE) x一般...
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- Daitoue
- 发布于 2018-11-23 14:52
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安生水
GEO数据与WGCNA--挖掘胶质瘤共表达网络的关键模块与通路
加权基因共表达网络（WGCNA）可以利用基因表达数据，构建出加权的基因共表达网络，从而挖掘协同表达的基因模块，探索基因模块与性状之间的关系。 这种分析方法在生物研究领域中被广泛使用，以...
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- Daitoue
- 发布于 2018-11-23 12:45
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获取关系矩阵（WGCNA)
在进行WGCNA分析的过程中需要基于表达矩阵转换关系矩阵，结合power值构建邻接矩阵，并由此构建TOM矩阵最终构建网络。在代码实现的过程中往往： 1、计算power值 2、基于power直接利用adjacen...
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- Daitoue
- 发布于 2018-11-23 10:11
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ValueError: invalid literal for int() with base 10: ''
python 版本mcscan 分析报错
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- omicsgene
- 发布于 2018-11-17 20:49
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AttributeError: 'LayoutLine' object has no attribute 'color'
python mcscan 运行报错
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- omicsgene
- 发布于 2018-11-17 20:39
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R语言获取两个数组向量交集与并集
在R语言中如何获取两个向量之间的交集与并集？ 交集可以用intersect 并集可以用union 譬如针对A,B两个向量： > A=LETTERS[1:10]> B=LETTERS[5:15]##交集 > intersect(A,B)[1] "E" ...
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- Daitoue
- 发布于 2018-11-16 17:14
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megacc构建进化树.mao文件生成方法
基于linux版megacc构建系统进化树命令如下： -a输入的是构建进化树的参数 .mao文件 -d输入的是多序列比对之后的结果文件，可以是fasta格式 -o 是输出路径 其中一个重要的文件 也就是参...
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- Daitoue
- 发布于 2018-11-16 17:06
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