GEO数据库dataset和profiles区别

GEOdataset

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-10-28 06:58
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Vennerable包的安装

Vennerable包并没有在CRAN,所以他的安装需要提供相应的链接,其安装方法可以在:http://r-forge.r-project.org/projects/vennerable 找到,或者  https://github.com/js229/Vennerable  后者...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-26 16:18
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linux下perl及bioperl安装

linux下perl及bioperl安装

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-26 14:27
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linux下Circos安装

linux下Circos安装

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-26 14:15
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linux下安装java

linux下安装java

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-26 13:36
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对R包的操作(查询、版本、更新等)

R中对包进行操作的命令很多,涉及从包的安装、查询、更新、卸载等等。这里介绍几个常见的操作

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-24 16:01
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免费下载中文文献神器-iData知识检索

iData知识检索是一个十分强大的文档搜索网站,是全球最大的知网镜像,支持免费下载中文期刊、硕博学位论文、会议论文、报纸全库等,以及部分年鉴内容(年鉴需要通过cnki镜像下载),iData搜索结果基本上和知网一样,输入文献题目即可下载。

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-10-22 10:21
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鲈鱼MAPK基因家族分析文献下载及解读

鲈鱼MAPK基因家族分析文献下载:Identification of mapk gene family in Lateolabrax maculatus and their expression profiles in response to hypoxia and salinity challenges.pdf

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-10-22 08:58
  • 阅读 ( 4518 )

蛋白质组分析软件MaxQuant

蛋白质组分析软件MaxQuant

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  • microRNA
  • 发布于 2018-10-19 17:01
  • 阅读 ( 5294 )

MEME使用参数说明

MEME参数使用说明使用说明

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-10-19 17:00
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TCGA-构建ceRNA网络的软件GDCRNATools

TCGA-构建ceRNA网络的软件GDCRNATools

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  • microRNA
  • 发布于 2018-10-19 16:13
  • 阅读 ( 3900 )

TCGA-ceRNA网络构建

TCGA-ceRNA网络构建

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  • microRNA
  • 发布于 2018-10-19 15:49
  • 阅读 ( 4455 )

plot单独画出pheatmap返回的聚类结果(聚类树)

前面两篇文章介绍到pheatmap返回行和列的hclust结果: pheatmap返回的结果解释(获得新的排序信息)  http://www.omicsclass.com/article/507 cutree对pheatmap返回结果实现聚类cluster划分 ...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-19 15:44
  • 阅读 ( 7806 )

腾讯云服务器获取指南

腾讯云服务器获取指南

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-19 15:35
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cutree对pheatmap返回结果实现聚类cluster划分

此前给大家介绍过pheatmap聚类后的矩阵数据重排:http://www.omicsclass.com/article/507 其中给大家介绍到了pheatmap返回结果是一个列表,其中包括行列聚类的返回结果,而这一结果又是基于hcl...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-19 14:53
  • 阅读 ( 16289 )

pheatmap返回的结果解释(获得新的排序信息)

pheatmap是一个热图绘制的R包,全称pretty heatmap。利用的绘图函数是pheatmap(),对应的数据则是一个数值矩阵,譬如基于如下的矩阵10X6: > mat              CK-WT-1      CK-WT-2     ...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-10-19 14:23
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多基因组基因水平共线性分析

多基因组基因水平共线性分析

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-19 13:39
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blastall 搜索比对输出结果 m8或者m9格式说明(blast+ m6格式)

blast 结果说明

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-10-19 12:06
  • 阅读 ( 13224 )

blastall 参数详细说明

用blastall进行序列比对,详细参数说明

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-10-19 11:49
  • 阅读 ( 13236 )

bedtools求交集

bedtools求交集 其用法: bedtools intersect [OPTIONS] [-a|-abam]-b BED 输入文件是bed格式,至少三列,分别...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-10-19 11:30
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