linux的简单命令(二)

linux常用命令 1:创建文件和和文件 mkdir+yangsm#表示 创建一个yangsm的一个文件夹 vim+yangsm.txt#表示创建一个yangsm.txt的一个文件 2:在vim文件中如何退出 a、Esc b、ctrl+;#可以加...

GoMapman-几种模式植物蛋白、代谢物、sRNA关于Mapman注释查询

推荐一个Mapman 本体查询的网站:GoMapman(http://www.gomapman.org/) 网站主要涉及了蛋白、代谢物以及sRNA在Mapman注释通路的查询。通过完整可以浏览具体的通路上可能会涉及那些基因,也可...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-26 13:24
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做韦恩图?自己搞定!

韦恩图又称文氏图,是科研文章中最常见的图,可以用来表示多个数据集之间的大致关系。小编来介绍几种常用在线绘制韦恩图的工具,简单易学!

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-26 11:08
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欢迎加入组学大讲堂问答社区

组学大讲堂问答社区,欢迎您加入 www.omicsclass.com

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-25 17:51
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rmvnorm函数生成随机矩阵

借助rmvnorm()生成一个多维正态随机矩阵 安装mvtnorm包 > install.packages("mvtnorm")> library(mvtnorm) 生成随机矩阵x=rmvnorm(n,mean=rep(0,nrow(sigma)),sigma=diag(length(mean)…)...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-25 11:42
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利用NCBI当中的CD-search工具预测基因的保守结构域

搜索鉴定基因的保守结构域,应该用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search,而不是简单的用blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是非常重要的,因为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域!

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-23 12:11
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18年上半年,利用GEO/TCGA数据库发表文章超过1000+

2018年最新利用TCGA/GEO数据库挖掘文章列表

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-07-23 11:42
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perl中的正则表达式

perl中的正则表达式

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-20 15:00
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GFF3格式说明

GFF3格式说明

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 12:01
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Muscle 进行多序列比对

MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件,在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候,大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:53
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blast比对结果说明

我们作比对时经常用到blast,其比对结果一般都用m8格式(即参数是 -m 8,blast+是 -outfmt 6),但是结果文件中是没有表头的,这里来写一下。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:13
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TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-20 10:58
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clusterProfiler做非模式物种的功能注释

clusterProfiler做非模式物种的功能注释

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-20 10:28
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植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman

你可以对基因进行功能注释,分析其功能分类以及相关的通路信息,你也能分析基因的表达谱数据,但是你知道如何将二者进行结合吗?在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据?有一个工具可以做...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-20 09:18
  • 阅读 ( 14703 )

如何鉴定测序文库是不是链特异性

如何鉴定测序文库是不是链特异性

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-19 13:55
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科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop

科研作图也需要会使用Adobe illustrator和Photoshop,用好了这两个软件也会使你的文章配图增色不少,甚至事半功倍。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-19 11:47
  • 阅读 ( 8723 )

java 安装以及环境变量配置

配置JAVA环境,运行java程序

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-18 22:38
  • 阅读 ( 12717 )

TCGA中癌症的名称,简写和中文名称

TCGA数据库中含有的癌症名称,简写和中文名称

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-18 22:37
  • 阅读 ( 32416 )

eclipse当中R插件StatET安装

StatET是一个eclipse R语言高亮显示插件,可以高亮显示R语言代码。安装之前请在电脑中提前安装好R编译环境。 支持在Eclipse平台上(通过将代码发送到R)运行R代码 支持语法高亮显示 支持使用R代码模板 支持创建R的文档文件(*.Rd) 可以从Eclipse运行R命令

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-18 16:19
  • 阅读 ( 6138 )

20个转录组基本知识点-你必须知道!

做转录组实验,发转录组文章,你不得不知道的20个基本知识点。