19小时前 回答问题

所以你在未做任何处理之前，你的gff文件里面基因ID的格式就是基因组名+基因id这样的是吗，我举个例子，比如说你的原始gff文件里面，你的基因编号就是C01_00G00000006对吗 还有你提到的这一点“之前是C01_C1_00G00000001，在做存在缺失时，我都把他们改了，我现在该怎么办啊”你不能随意的改动你原始的基因id，不然后面就会出现对不上的情况，你需要改回来

1天前 发表了文章

2天前 回答问题

awk 'FNR>1{print $1"\t"$2"_"$3}' 26Pan-genes.list > 26mazi.pan-genes.list

3天前 回答问题

last报错应该是因为内存不足：https://www.omicsclass.com/article/1413

3天前 回答问题

你这应该是没有跑完，你看下结果有没有正常生成，建议你重新执行一下计算kaks的指令，另外你不用把之前的容器删除掉，你这个容器还是up的状态，直接attach重连就行： docker attach 你的容器id

2025-03-27 15:47 回答问题

我们的代码里面有对文件进行正确拆分的部分： 你是从上一步完整的跑下来的吗，如果你的PAVlist和示例数据格式一样的话不应该会出现这样的问题

2025-03-27 09:21 回答问题

你需要给我们提供一下明确的报错信息截图，你可以看一下发表问题的规范：https://www.omicsclass.com/article/82 因为软件报错的原因有很多种，需要有针对性解决

2025-03-27 09:19 回答问题

如果你的vcf文件格式规范的话，你可以试一下vcftools：https://www.omicsclass.com/article/647

2025-03-24 13:15 回答问题

可以参考一下我们示例数据使用的文章材料方法部分的描述：

2025-03-21 11:23 回答问题

你这行代码是哪个脚本里的，我们课程里面没有用到这个软件把