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3小时前 回答问题
你给VCF文件加一个绝对路径，再跑一下试试
9小时前 回答问题
你看下你的gvcf文件里面的染色体编号是不是4，还是chr4或者Chr4，是不一样的
10小时前 回答问题
你这条指令是哪个脚本里面的
10小时前 回答问题
你检查一下输入文件(fastq)的文件名是不是正确的，还有路径
3天前 回答问题
建一下参考基因组索引：
3天前 回答问题
你可以看一下咱们课程中的示例数据，有讲文件中包含重要信息的列都是什么，你可以根据示例数据进行整理，vcf不是一种文件类型，你可以理解为存储基因组变异信息的一种格式，咱们课程里的是比较规范的，基因组之间进行比对call SV的vcf结果文件格式。
3天前 回答问题
可以使用gz格式压缩fastq，或者可以直接解压运行，zip格式应该是不可以的
4天前 回答问题
一般作者都会把文章中可以公开的数据上传到公共数据库，可以根据项目编号去对应的数据库中下载
2025-02-24 10:04 回答问题
同学，你下次问问题的时候不要重新开贴，直接在原文下面回答就可以，不然我们没法对应到你问题的上下文，还得去翻你的提问记录，这样很没有效率，你可以看一下提问的规范：提问规范，另外你说的报错如果还是你之前提到的no such file的问题，已经给你回答过了，是你没有正确读入变量名，你检查一下，你看下前面是不是有一条指令：for i in `...`;do,你没有完整的执行这个循环，所以会报错，你再好好看看课程，或者学习一下linux基础操作。
2025-02-21 18:27 回答问题
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