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6天前 发表了文章

2024-12-12 16:09 回答问题

“PAV文件中不同的fam号对应了同一个基因后”,这是什么意思,我没太理解,请提供更详细的说明

2024-12-12 16:05 回答问题

课程里面的SV结果是分样本做SV calling后,使用merge合并的结果,你的这个格式确实与课程里的不一样,需要写代码手动提取一下有用的信息

2024-12-12 13:57 回答问题

sed -i 's/Marker/chr\tpos/' glm_pvale.txt ,s前面没有l

2024-12-09 10:16 发表了文章

2024-12-06 08:08 回答问题

同学,你的gene.list和pangene.list的第二列编号格式没有对上,你修改一下。

2024-12-03 13:31 回答问题

你可以看看泛基因家族分析课程的数据准备部分,如果只是跟着流程做分析的话,基因组部分只需要准备10个物种的基因组文件(fasta格式)和gff文件就可以

2024-12-03 11:44 回答问题

同学你其他的模型跑出来结果也是这样还是只有GLM模型是这样的,另外你用多少个样本去做的分析?

2024-12-03 11:26 回答问题

你直接把你的指令贴上来,不要以附件的形式,你这个提供的信息太少了没办法确定问题,另外你检查一下你的脚本中第23行有没有写错,有没有一些多余的字符

2024-11-29 11:03 回答问题

因为你没有给我们提供文件的信息,无法具体进行判断,只能通过文件名字推断“Capra_hircus.ARS1.113.chr.gff3.gz”可能是是包含染色体水平的基因组的注释信息文件,具体选择哪个还要看你自己的分析需求