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84 个回答

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老师您好,分析SNP和INDEL时报错,请解答。

你给VCF文件加一个绝对路径,再跑一下试试

回答于 10小时前

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重测序分析

你看下你的gvcf文件里面的染色体编号是不是4,还是chr4或者Chr4,是不一样的

回答于 16小时前

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提取VCF 文件里的SNP

你这条指令是哪个脚本里面的

回答于 16小时前

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老师您好,我在参考基因组比对的时候,出现报错,请老师解答

你检查一下输入文件(fastq)的文件名是不是正确的,还有路径

回答于 16小时前

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老师您好,在参考基因组比对时出错。

建一下参考基因组索引:

回答于 3天前

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老师,构建泛基因列表使用的vcf文件,是下面图中的sv数据吗,下...

你可以看一下咱们课程中的示例数据,有讲文件中包含重要信息的列都是什么,你可以根据示例数据进行整理,vcf不是一种文件类型,你可以理解为存储基因组变异信息的一种格式,咱们课程里的是比较规范的,基因组之间进行比对call SV的vcf结果文件格式。

回答于 3天前

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数据质控出现报错

可以使用gz格式压缩fastq,或者可以直接解压运行,zip格式应该是不可以的

回答于 3天前

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如何下载别人的重测序数据

一般作者都会把文章中可以公开的数据上传到公共数据库,可以根据项目编号去对应的数据库中下载,可以参考一下这篇文章:NCBI、ENA高通量测序数据下载-fastq数据

回答于 4天前

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IBD 计算2

同学,你下次问问题的时候不要重新开贴,直接在原文下面回答就可以,不然我们没法对应到你问题的上下文,还得去翻你的提问记录,这样很没有效率,你可以看一下提问的规范:提问规范,另外你说的报错如果还是你之前提到的no such file的问题,已经给你回答过了,是你没有正确读入变量名,你检查一下,你看下前面是不是有一条...

回答于 2025-02-24 10:04

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老师,我想做一下分子方差分析AMOVA,咱们有相关的代码嘛,好多...

如果需要做相关分析联系客服:联系客服

回答于 2025-02-21 18:27