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老师您好，我在做泛基因家族分析中存在缺失分析得到的基因家族泛...
所以你在未做任何处理之前，你的gff文件里面基因ID的格式就是基因组名+基因id这样的是吗，我举个例子，比如说你的原始gff文件里面，你的基因编号就是C01_00G00000006对吗，要是你描述的这种情况，你需要把这条指令改成这样：awk 'FNR>1{print $1"\t"$3"_"$2"_"$3}' final.last.gene.pair.txt > yourfile.pan-genes.li...
回答于 1天前
老师您好，我正在做泛基因家族分析中，家族成员存在缺失分析，需...
awk 'FNR>1{print $1"\t"$2"_"$3}' 26Pan-genes.list > 26mazi.pan-genes.list
回答于 3天前
正在运行命令的docker因为断网后重启还可以继续运行上次的代码吗...
你这应该是没有跑完，你看下结果有没有正常生成，建议你重新执行一下计算kaks的指令，另外你不用把之前的容器删除掉，你这个容器还是up的状态，直接attach重连就行： docker attach 你的容器id
回答于 4天前
kaks分析时候基因的txt文件中基因的出现乱序如何使用代码进行统...
我们的代码里面有对文件进行正确拆分的部分： 你是从上一步完整的跑下来的吗，如果你的PAVlist和示例数据格式一样的话不应该会出现这样的问题
回答于 2025-03-27 15:47
从https://ricerc.sicau.edu.cn/下载的基因组和gff文件进行水稻...
你需要给我们提供一下明确的报错信息截图，你可以看一下发表问题的规范：https://www.omicsclass.com/article/82 因为软件报错的原因有很多种，需要有针对性解决
回答于 2025-03-27 09:21
老师，合并后的VCF文件，现在有几品种不想要了，如何从总的VCF文...
如果你的vcf文件格式规范的话，你可以试一下vcftools：https://www.omicsclass.com/article/647
回答于 2025-03-27 09:19
老师您好，针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/77...
“发现P-Value的原始文件有NaN的情况”，应该是你有些SNP位点缺失率过高之类的情况，大概是你前期的数据过滤不是很严格，你画图的时候直接删掉这样的数据就可以 关于你提出的曼哈顿图上面的点显示不全的问题，你可以对脚本进行如下的修改： scale_y_continuous(expand = c(0,0.05) 即把脚本中的y轴坐标轴上限增加5％
回答于 2025-03-19 16:32