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泛基因，SV ，VCF文件格式为4.2 ，没有课程里要求的SUPP_VEC和SV...
课程里面的SV结果是分样本做SV calling后，使用merge合并的结果，你的这个格式确实与课程里的不一样，需要写代码手动提取一下有用的信息
回答于 2024-12-12 16:05
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sed -i 'ls/Marker/chr\tpos/' glm_pvale.txt sed: -e 表...
sed -i 's/Marker/chr\tpos/' glm_pvale.txt ，s前面没有l
回答于 2024-12-12 13:57
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泛基因家族分析-数据准备
你可以看看泛基因家族分析课程的数据准备部分，如果只是跟着流程做分析的话，基因组部分只需要准备10个物种的基因组文件（fasta格式）和gff文件就可以
回答于 2024-12-03 13:31
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老师您好，做GWAS分析使用GLM模型时，p值为什么都是-0啊？
同学你其他的模型跑出来结果也是这样还是只有GLM模型是这样的，另外你用多少个样本去做的分析？
回答于 2024-12-03 11:44
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genome
因为你没有给我们提供文件的信息，无法具体进行判断，只能通过文件名字推断“Capra_hircus.ARS1.113.chr.gff3.gz”可能是是包含染色体水平的基因组的注释信息文件，具体选择哪个还要看你自己的分析需求
回答于 2024-11-29 11:03
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