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38 个回答

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结构变异结果各个信息都代表什么,缺失和插入位点如何查看呢

第一列:变异相对于基因发生的位置,第二列:发生结构变异的基因id,第三列:变异所在的染色体,第四-五列:变异发生的位置坐标,两列0不用管是占位的,后面一列是说明变异的类型,最后一列是附加信息,是我添加上去说明变异发生在哪些基因组中,除了前五列,其余都是附加选项,建议你看下annovar的手册或许对你有帮助:htt...

回答于 2024-09-24 09:44

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KAKS作图问题

同学,问题一,你可以尝试着改变一下这个比例,比如从1/20调整到1/10试试看; 问题二,目前改脚本比较麻烦,建议直接从输入文件那里把不需要绘制的基因删掉更简单

回答于 2024-09-24 09:40

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提取可靠基因家族成员的结构域序列

不应该会没有结果,你的list文件里面的基因id应该来自于你的hmmer文件,你要确保两个文件中的id对得上

回答于 2024-09-14 14:09

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提取CDS和蛋白序列出错

你把输入文件截图给我看下,根据报错来看你还是没有改成一样的,你确认一下大小写是否也一样,然后你看一下,在gff文件和fasta文件里面是不是都有Ctg106,是不是你的gff文件和fasta文件里面的contig数量不一样?

回答于 2024-09-10 15:30

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GWAS分析绘制进化树遇到下面问题是什么意思,请问怎么解决?

行名重复了,你看下输入文件的行名是否有重复项

回答于 2024-09-09 17:41

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提取CDS和蛋白序列出错

你这个报错是因为你的fasta序列的染色体id和gff文件里面对不上,你改一下

回答于 2024-09-05 14:27

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putty 跑保留最长转录本,跑了一两个小时后突然没反应了,出现i...

重跑把,这回不要在前台直接跑了,使用nohup把任务挂载到后台再跑,这样就算是你终端的连接断开,任务也能继续在后台运行: nohup 你要执行的指令 &

回答于 2024-09-05 14:25

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泛基因家族 提取CDS序列和pep序列 跑了很久之后,显示没有权限

不是权限的问题,注意文件的路径不要写错

回答于 2024-09-03 13:58

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绘制ka/ks没有ARF1

同学,你把ARF1的kaks计算结果贴过来看下

回答于 2024-08-28 13:16

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R语言GAPIT跑GWAS,ERROR求解:不能有负长度矢量,万分感谢!!...

同学,你贴一下你的基因型文件和表型文件看看格式是不是有问题

回答于 2024-08-27 17:48