38 个回答
在做GWAS关联分析，利用gapit软件发现不同模型产生的hd.$m.GWAS....
用官网提供的demo数据去跑了一下gapit这几种不同的模型，得到的结果确实存在这种情况，流程和脚本没有问题，这种情况估计是不是样本之间的亲缘关系比较近，加上都是混合线性模型，所以得到的结果相似性比较高，你也可以用gapit他们提供的代码跑下，确实是也有这样的情况：https://github.com/jiabowang/GAPIT?tab=readme-ov...
回答于 2024-08-27 16:45
要进行单倍型分析，但是镜像不是搭建在2.0版本了，docker pull下...
你看一下你的压缩包上传的时候有没有损坏，检查一下压缩包的完整性，重新上传一遍
回答于 2024-08-23 10:32
无法打开docker镜像
同学，work 文件夹和后面的镜像名称之间是要有空格的，正确写法应该是 -v ~:/work omicsclass/organelle-assembly:v1.0
回答于 2024-08-05 11:32
只提取出来一个是为什么呀？是不是不对呀？
同学，你这个给的信息比较少，根据你现在的这个情况，你首先检查一下你鉴定到的家族基因的基因id是否和列表中能够对应上，如果能对应上只是你鉴定到的基因不在列表里的话，那说明这些基因的同源性比较差，你要考虑针对你的基因家族，选择一些近缘的基因组了。另外同一个问题提一遍就可以了哈，注意一下提问技巧，看一下这个...
回答于 2024-07-18 11:54
绘制PPI互作网络报错
同学，我需要你给我看看你的输入文件： TF_fpkm.xls WRKY_deg_fpkm.xls meta.2.txt 还有你运行的指令 还有如果你生成了一些cor开头的文件也给我看下吧
回答于 2024-07-09 11:49
单倍型报错
同学，你执行R脚本的时候-c 参数应该给的是分析的染色体编号，我看你给的这个染色体编号怎么好像和gff文件里对不上，你再检查一下看看是不是，另外再提醒你一下，这个-s 和-e的参数是你要分析的所有snp位点的最开始那个snp和最后一个snp位点的位置（如果是基因的话就是基因在染色体上的起始和终止位置），不要填错了哈
回答于 2024-07-05 09:43
运行时没有报错，pairid也是和demo里的内容一样，我没上直播，但...
同学，你跟我说的是没有报错信息的，但是你这个是报错了的哈，你看一下你这条命令是exit的状态，他提示你有一个基因的序列是不存在的，你看到了吗，你看一下你前面B97的基因组是不是不完整的，没下载完或者是没处理完： 另外提问的时候注意提问技巧，可以看一下这个帖子：https://www.omicsclass.com/article/82
回答于 2024-06-27 11:37