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84 个回答

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GWAS分析绘制进化树遇到下面问题是什么意思,请问怎么解决?

行名重复了,你看下输入文件的行名是否有重复项

回答于 2024-09-09 17:41

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提取CDS和蛋白序列出错

你这个报错是因为你的fasta序列的染色体id和gff文件里面对不上,你改一下

回答于 2024-09-05 14:27

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putty 跑保留最长转录本,跑了一两个小时后突然没反应了,出现i...

重跑把,这回不要在前台直接跑了,使用nohup把任务挂载到后台再跑,这样就算是你终端的连接断开,任务也能继续在后台运行: nohup 你要执行的指令 &

回答于 2024-09-05 14:25

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泛基因家族 提取CDS序列和pep序列 跑了很久之后,显示没有权限

不是权限的问题,注意文件的路径不要写错

回答于 2024-09-03 13:58

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绘制ka/ks没有ARF1

同学,你把ARF1的kaks计算结果贴过来看下

回答于 2024-08-28 13:16

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R语言GAPIT跑GWAS,ERROR求解:不能有负长度矢量,万分感谢!!...

同学,你贴一下你的基因型文件和表型文件看看格式是不是有问题

回答于 2024-08-27 17:48

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在做GWAS关联分析,利用gapit软件发现不同模型产生的hd.$m.GWAS....

用官网提供的demo数据去跑了一下gapit这几种不同的模型,得到的结果确实存在这种情况,流程和脚本没有问题,这种情况估计是不是样本之间的亲缘关系比较近,加上都是混合线性模型,所以得到的结果相似性比较高,你也可以用gapit他们提供的代码跑下,确实是也有这样的情况:https://github.com/jiabowang/GAPIT?tab=readme-ov...

回答于 2024-08-27 16:45

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要进行单倍型分析,但是镜像不是搭建在2.0版本了,docker pull下...

你看一下你的压缩包上传的时候有没有损坏,检查一下压缩包的完整性,重新上传一遍

回答于 2024-08-23 10:32

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单倍型结果的解读

这两个图主要是看不同单倍型之间的表型差异的,p值越小表明两个单倍型之间的表型差异越大

回答于 2024-08-21 13:29

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老师您好,为什么在gwas最后的筛选关联区域SNP信息时,总报错错...

建议使用我们课程中提供的docker镜像进行分析

回答于 2024-08-05 11:33