31 个问题

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• 做群体遗传分析，需要把indel提取出来嘛只用SNP的vcf文件？

  1/1010

  2023-12-08 10:12
• gatk VariantFiltration这一步的过滤，我看到gatk 官网上SNP和indel的过滤条件有点不一样。是否可以把SNP和indel从all.raw.vcf.gz提取出来个各自硬过滤后再合并做后面的分析？

  0/780

  2023-12-06 17:27
• 基因流分析时，treemix.r报错

  1/974

  2023-11-08 23:35
• 合并选择区域时出现错误，请教一下，要怎么解决呢？是不是把前面的- 删掉

  2/1082

  2023-11-08 10:11
• 老师，请问下在这个文件中Fst.top0.05.gene.txt，哪个是基因的名字，

  1/715

  2023-11-08 00:35
• 做psmc的时候，显示没有这个get_fa_by_id.pl

  1/726

  2023-11-06 16:12
• 老师，请教一下下载的参考基因组染色体名字不一样，有什么办法改成一致的名字嘛？比如chr1改成DD_shr1

  1/764

  2023-11-04 15:38
• 没有 easySFS.py

  1/844

  2023-11-03 08:13
• index.sh构建索引时，其他文件都正常，但是这个unknown_refGeneMrna.fa文件是空的

  0/729

  2023-11-03 01:26
• dadi 分析中根据基因组创建annovar库出现报错

  2/913

  2023-11-03 00:17